RNA–Protein interactions for RNA: YGL018C

JAC1, Transcript of Specialized J-protein that functions in Fe-S cluster biogenesis, yeast

Gene JAC1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
JAC1	YGL018C	COX5A	P00424	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	STE6	P12866	1290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	TUP1	P16649	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RNQ1	P25367	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	DCC1	P25559	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MCM2	P29469	868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	HOG1	P32485	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	LYP1	P32487	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	AIM26	P32858	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	JNM1	P36224	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	IML3	P38265	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	KHA1	P40309	873 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	ATM1	P40416	690 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	YIR014W	P40570	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SPG5	P42933	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	CIA1	Q05583	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	CDA2	Q06703	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
JAC1	YGL018C	PCT1	P13259	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	EMC1	P25574	760 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	NTH1	P32356	751 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	PLC1	P32383	869 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	AEP1	P32493	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SQT1	P35184	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	EMC3	P36039	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	CYC2	P38909	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SLX8	P40072	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	ELO3	P40319	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SSU1	P41930	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	UBX6	P47049	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RFX1	P48743	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	YGL260W	P53056	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RSC4	Q02206	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	TRS23	Q03784	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	IVY1	Q04934	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	AAD15	Q08361	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	TMA16	Q08687	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	DIT1	P21623	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MEI4	P29467	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	DOM34	P33309	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	GMH1	P36125	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MTG2	P38860	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MGS1	P40151	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RGD2	P43556	714 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	COG1	P53079	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	CDC14	Q00684	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	FRT1	Q99332	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	HOP1	P20050	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SFL1	P20134	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	YCR006C	P25350	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	MSH1	P25846	959 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SEC65	P29478	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	PSY4	P38193	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
JAC1	YGL018C	TIM17	P39515	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	VFA1	P40080	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	IKS1	P47042	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	ASK10	P48361	1146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	SAP4	P53036	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	ARP4	P80428	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	CDA1	Q06702	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
JAC1	YGL018C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	TMS1	Q12116	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JAC1	YGL018C	NHA1	Q99271	985 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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