RNA–Protein interactions for RNA: YGL011C

SCL1, Transcript of Alpha 1 subunit of the 20S proteasome, yeast

Gene SCL1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCL1	YGL011C	CDC16	P09798	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	SAN1	P22470	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	PAH1	P32567	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	IRC7	P43623	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	ORC5	P50874	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	INN1	P53901	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	PET111	P08468	800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	MSS51	P32335	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	LHS1	P36016	881 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	ECM10	P39987	644 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	SLZ1	P40167	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	SNO3	P43544	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	YSA1	Q01976	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	MUB1	Q03162	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	RSM28	Q03430	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	YKU80	Q04437	629 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	SKM1	Q12469	655 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCL1	YGL011C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	AAC3	P18238	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	CDC15	P27636	974 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	COQ3	P27680	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	MRX1	P40050	688 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YFR020W	P43600	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	AAD10	P47182	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	RAD30	Q04049	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	GAL4	P04386	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	GPA1	P08539	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	TMA108	P40462	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	XBP1	P40489	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	PDR8	Q06149	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	ENT1	Q12518	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	CHO1	P08456	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	MDM10	P18409	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YCR006C	P25350	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	OCT1	P35999	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	ARN1	P38731	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	JHD1	P40034	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YJL107C	P42947	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	VPS72	Q03388	795 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	MCH4	Q08268	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	PXL1	P36166	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	ESL2	P36168	1195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SCL1	YGL011C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	CTK2	P46962	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	PFA5	Q03289	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	CRC1	Q12289	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	RRI2	Q12348	645 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	ATG9	Q12142	997 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	SEM1	O94742	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	KAR3	P17119	729 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	RTS1	P38903	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	LTP1	P40347	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	INA17	Q02888	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	PIG1	Q06216	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	RRI1	Q12468	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCL1	YGL011C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	PRE8	P23639	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	STE50	P25344	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	MAL33	P38157	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	VPS41	P38959	992 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YIL024C	P40543	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	PSR1	Q07800	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	FRE3	Q08905	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	RAP1	P11938	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	CNA1	P23287	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YCK1	P23291	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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