RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	TDA3	P38758	523 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YHR218W	P38899	603 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YNL195C	P40168	261 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	APS3	P47064	194 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SSN8	P47821	323 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	BRO1	P48582	844 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	KAP114	P53067	1004 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SPC105	P53148	917 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	COX18	P53239	316 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	ATG4	P53867	494 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	UME1	Q03010	460 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	MUB1	Q03162	620 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YLR287C	Q05881	355 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	DCS1	Q06151	350 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	VAC14	Q06708	880 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	NSE1	Q07913	336 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	TMA16	Q08687	178 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	BUG1	Q12191	341 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	ZRT2	Q12436	422 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	DOP1	Q03921	1698 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	PMS1	P14242	873 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SEC63	P14906	663 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	KIN3	P22209	435 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	PRP28	P23394	588 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	PHO3	P24031	467 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	RPC53	P25441	422 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	CDC15	P27636	974 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YKU70	P32807	602 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	BCS1	P32839	456 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	MIA40	P36046	403 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YKR075C	P36155	307 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	UBS1	P38290	277 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	RCK2	P38623	610 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	VMA22	P38784	181 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	CCT6	P39079	546 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	ERP2	P39704	215 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YER130C	P39959	443 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	ARG2	P40360	574 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SER33	P40510	469 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	LYS14	P40971	790 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YFH7	P43591	353 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	GPG1	P53130	126 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YNL058C	P53947	316 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	INA17	Q02888	182 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	GTB1	Q04924	702 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	RTT109	Q07794	436 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.48	□□□□□ -1.85	not detected
ECO1	YFR027W	SMC5	Q08204	1093 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	VHS3	Q08438	674 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	MLH3	Q12083	715 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	POM34	Q12445	299 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	ARP6	Q12509	438 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	RED1	P14291	827 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	CDC43	P18898	376 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	DAP2	P18962	818 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	APN1	P22936	367 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YCR051W	P25631	222 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	VPS51	P36116	164 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YBR225W	P38321	900 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YJL206C	P39529	758 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	IES5	P40060	125 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	PIG2	P40187	538 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SPO22	P40511	975 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	BIT61	P47041	543 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	SRB7	P47822	140 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ECO1	YFR027W	YGR153W	P48238	217 aa		3.47	□□□□□ -1.85

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