RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W STP3Q05937 343 aa3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W THI3Q07471 609 aa3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W SUI3P09064 285 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W ASG1P40467 964 aa3.56□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W IST3P40565 148 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W COG1P53079 417 aa3.56□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YML003WP0CF16 290 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-FP0CX61 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TRX2P22803 104 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-CP25383 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W CNS1P33313 385 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W EXO84P38261 753 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W IFA38P38286 347 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W PHM8P40025 321 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W SAD1P43589 448 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W CTF18P49956 741 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W ADE16P54113 591 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W GTR1Q00582 310 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-DR2Q03483 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W SWA2Q06677 668 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-BQ12260 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-OR2Q12293 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-DR1Q12392 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-OR1Q12439 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TY2A-DR3Q99303 438 aa3.55□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YFL068WP0CX99 160 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YLL066W-AP0CY00 160 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YLL067W-AP0CY01 160 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W SLC1P33333 303 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TFC3P34111 1160 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W RKM3P38222 552 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W VRG4P40107 337 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W UBP7P40453 1071 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TMA16Q08687 178 aa3.54□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YLR302CO13544 120 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W CDC15P27636 974 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W MRX1P40050 688 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W RIC1P40395 1056 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YPR003CP53394 754 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W BET4Q00618 327 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W FCP1Q03254 732 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YMR317WQ04893 1140 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W PDR8Q06149 701 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W PCD1Q12524 340 aa3.53□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W OCT1P35999 772 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W LHS1P36016 881 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W PCL6P40038 420 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W VPS25P47142 202 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W YML131WQ03102 365 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W VID22Q05934 901 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W CRN1Q06440 651 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W NUS1Q12063 375 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W YLR049CQ12110 428 aa3.52□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W YSP3P25036 478 aa3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W SOF1P33750 489 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W GEX2P36173 615 aa3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W PFK26P40433 827 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W UBP8P50102 471 aa3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W TFC6Q06339 672 aa3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W MCH4Q08268 501 aa3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W TRM8Q12009 286 aa3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W NBP2Q12163 236 aa3.51□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W PCT1P13259 424 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W YCR006CP25350 157 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W RER1P25560 188 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W PPZ1P26570 692 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W SRB5P32585 307 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W ADE17P38009 592 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W CDC1P40986 491 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W BNA1P47096 177 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W VPS4P52917 437 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W REG1Q00816 1014 aa3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W ERG8P24521 451 aa3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W SSH4P32343 579 aa3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W RRN3P36070 627 aa3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W UBP13P38187 747 aa3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W SDS24P38314 527 aa3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W VPS41P38959 992 aa3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W YER010CP40011 234 aa3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W YMR018WQ04364 514 aa3.49□□□□□ -1.85
NSE4YDL105W FMP42Q04991 504 aa3.49□□□□□ -1.85
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