RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa14.3□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NelfbQ8C4Y3 580 aa14.3□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Med10Q9CXU0 135 aa14.3□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pex3Q9QXY9 372 aa14.3□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tldc2A2ACG1 198 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnaseh1O70338 285 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Capza3P70190 299 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pald1P70261 859 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ctnna3Q65CL1 895 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Glrx3Q9CQM9 337 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CsadQ9DBE0 493 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MetP16056 1379 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcif1P59114 706 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dzip1lQ499E4 774 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrkQ64010 304 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata21Q8BHW6 681 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mknk2Q8CDB0 459 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnv2Q8CFS6 562 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd10Q922M3 315 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mx2Q9WVP9 655 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myo5cE9Q1F5 1742 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adamts7Q68SA9 1657 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp10bB1AWN4 1474 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sema3eP70275 775 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BaatQ91X34 420 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EgfrQ01279 1210 aa14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrxn1Q9CS84 1514 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnajc25A2ALW5 357 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt13P08730 437 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tagap1P0CAX8 505 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnni3P48787 211 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgfr1opQ66JX5 399 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sdccag8Q80UF4 717 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp44Q8C2S0 711 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galnt15Q9D2N8 638 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt24A1L317 512 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scg2Q03517 617 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psd3Q2PFD7 1037 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Qrich1Q3UA37 777 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam196bQ6GQV1 535 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mpp4Q6P7F1 635 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LarsQ8BMJ2 1178 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Capn12Q9ER56 720 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grem2O88273 168 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp781Q0P5U5 243 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C87499Q3UX49 493 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ctdspl2Q8BG15 465 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plcd3Q8K2J0 785 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa14.28□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm11549A0A286YD83 63 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E9QMW4 1145 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eef2kO08796 724 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc4a1P04919 929 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ftl1P29391 183 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Senp1P59110 640 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elf1Q60775 612 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Senp6Q6P7W0 1132 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Flt1P35969 1333 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp213E9QAW0 468 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alppl2P24823 529 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rfc4Q99J62 364 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa14.27□□□□□ -0.12
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlr8P58682 1032 aa14.27□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Otop3Q80UF9 577 aa14.27□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Erlin1Q91X78 346 aa14.27□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apol7aB2RT54 418 aa14.27□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5935Q497S0 212 aa14.27□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9DAQ4 598 aa14.27□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28919A0A087WP35 240 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c68K7N6C2 491 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdha4O88689 947 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eepd1Q3TGW2 569 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgl1Q60695 768 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc17a8Q8BFU8 601 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dclk3Q8BWQ5 790 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde1cQ64338 706 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Skor2A7M7C7 1008 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c69E9PXC3 491 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc32G3XA59 663 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ByslO54825 436 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c40P56657 491 aa14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vat1lQ80TB8 417 aa14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.8 ms