Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,95■■■■■ 4,63
Scg2Q03517 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Scg2Q03517 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Scg2Q03517 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Scg2Q03517 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,69■■■■□ 3,78
Scg2Q03517 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Scg2Q03517 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,01■■■■□ 3,68
Scg2Q03517 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,96■■■■□ 3,67
Scg2Q03517 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,91■■■■□ 3,66
Scg2Q03517 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Scg2Q03517 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Scg2Q03517 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Scg2Q03517 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,74■■■■□ 3,47
Scg2Q03517 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Scg2Q03517 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Scg2Q03517 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
Scg2Q03517 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,3■■■■□ 3,4
Scg2Q03517 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Scg2Q03517 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Scg2Q03517 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Scg2Q03517 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Scg2Q03517 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Scg2Q03517 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Scg2Q03517 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Scg2Q03517 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Scg2Q03517 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Scg2Q03517 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,65■■■■□ 3,3
Scg2Q03517 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Scg2Q03517 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,5■■■■□ 3,27
Scg2Q03517 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Scg2Q03517 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Scg2Q03517 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Scg2Q03517 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Scg2Q03517 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Scg2Q03517 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Scg2Q03517 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,8■■■■□ 3,16
Scg2Q03517 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Scg2Q03517 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Scg2Q03517 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Scg2Q03517 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Scg2Q03517 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Scg2Q03517 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Scg2Q03517 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Scg2Q03517 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Scg2Q03517 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Scg2Q03517 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Scg2Q03517 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Scg2Q03517 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Scg2Q03517 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Scg2Q03517 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Scg2Q03517 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Scg2Q03517 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Scg2Q03517 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Scg2Q03517 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Scg2Q03517 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Scg2Q03517 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Scg2Q03517 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Scg2Q03517 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Scg2Q03517 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Scg2Q03517 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Scg2Q03517 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Scg2Q03517 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Scg2Q03517 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Scg2Q03517 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Scg2Q03517 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Scg2Q03517 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Scg2Q03517 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Scg2Q03517 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Scg2Q03517 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Scg2Q03517 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Scg2Q03517 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Scg2Q03517 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Scg2Q03517 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Scg2Q03517 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Scg2Q03517 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Scg2Q03517 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
Scg2Q03517 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Scg2Q03517 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Scg2Q03517 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Scg2Q03517 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Scg2Q03517 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,89
Scg2Q03517 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Scg2Q03517 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Scg2Q03517 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,98■■■□□ 2,87
Scg2Q03517 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Scg2Q03517 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Scg2Q03517 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Scg2Q03517 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Scg2Q03517 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Scg2Q03517 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Scg2Q03517 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Scg2Q03517 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Scg2Q03517 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Scg2Q03517 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Scg2Q03517 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Scg2Q03517 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Scg2Q03517 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Scg2Q03517 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Scg2Q03517 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Scg2Q03517 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44,8 ms