Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
Scg2Q03517 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Scg2Q03517 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Scg2Q03517 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Scg2Q03517 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Scg2Q03517 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Scg2Q03517 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Scg2Q03517 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Scg2Q03517 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Scg2Q03517 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Scg2Q03517 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Scg2Q03517 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Scg2Q03517 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Scg2Q03517 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Scg2Q03517 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Scg2Q03517 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Scg2Q03517 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Scg2Q03517 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Scg2Q03517 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Scg2Q03517 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Scg2Q03517 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Scg2Q03517 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Scg2Q03517 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Scg2Q03517 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Scg2Q03517 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Scg2Q03517 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Scg2Q03517 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Scg2Q03517 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Scg2Q03517 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Scg2Q03517 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Scg2Q03517 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Scg2Q03517 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Scg2Q03517 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Scg2Q03517 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Scg2Q03517 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Scg2Q03517 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Scg2Q03517 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Scg2Q03517 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Scg2Q03517 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Scg2Q03517 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Scg2Q03517 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Scg2Q03517 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scg2Q03517 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Scg2Q03517 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Scg2Q03517 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Scg2Q03517 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Scg2Q03517 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Scg2Q03517 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Scg2Q03517 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Scg2Q03517 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Scg2Q03517 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Scg2Q03517 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Scg2Q03517 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Scg2Q03517 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Scg2Q03517 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Scg2Q03517 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Scg2Q03517 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Scg2Q03517 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Scg2Q03517 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Scg2Q03517 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scg2Q03517 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Scg2Q03517 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scg2Q03517 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scg2Q03517 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Scg2Q03517 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Scg2Q03517 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Scg2Q03517 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Scg2Q03517 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Scg2Q03517 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Scg2Q03517 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Scg2Q03517 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Scg2Q03517 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Scg2Q03517 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Scg2Q03517 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Scg2Q03517 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Scg2Q03517 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Scg2Q03517 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Scg2Q03517 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Scg2Q03517 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Scg2Q03517 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Scg2Q03517 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Scg2Q03517 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Scg2Q03517 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Scg2Q03517 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Scg2Q03517 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Scg2Q03517 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Scg2Q03517 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Scg2Q03517 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Scg2Q03517 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Scg2Q03517 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Scg2Q03517 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Scg2Q03517 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Scg2Q03517 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Scg2Q03517 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Scg2Q03517 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scg2Q03517 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Scg2Q03517 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Scg2Q03517 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Scg2Q03517 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scg2Q03517 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms