Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Capza3P70190 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Capza3P70190 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Capza3P70190 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Capza3P70190 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Capza3P70190 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Capza3P70190 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Capza3P70190 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Capza3P70190 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Capza3P70190 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Capza3P70190 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Capza3P70190 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Capza3P70190 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Capza3P70190 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Capza3P70190 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Capza3P70190 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Capza3P70190 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Capza3P70190 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Capza3P70190 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Capza3P70190 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Capza3P70190 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Capza3P70190 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Capza3P70190 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Capza3P70190 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Capza3P70190 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Capza3P70190 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Capza3P70190 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Capza3P70190 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Capza3P70190 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Capza3P70190 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Capza3P70190 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Capza3P70190 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Capza3P70190 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Capza3P70190 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Capza3P70190 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Capza3P70190 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Capza3P70190 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Capza3P70190 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Capza3P70190 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Capza3P70190 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Capza3P70190 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Capza3P70190 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Capza3P70190 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Capza3P70190 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Capza3P70190 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Capza3P70190 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Capza3P70190 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Capza3P70190 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Capza3P70190 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Capza3P70190 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Capza3P70190 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Capza3P70190 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Capza3P70190 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Capza3P70190 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Capza3P70190 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Capza3P70190 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Capza3P70190 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Capza3P70190 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Capza3P70190 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Capza3P70190 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Capza3P70190 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Capza3P70190 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Capza3P70190 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Capza3P70190 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Capza3P70190 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Capza3P70190 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Capza3P70190 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Capza3P70190 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Capza3P70190 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Capza3P70190 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Capza3P70190 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Capza3P70190 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Capza3P70190 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Capza3P70190 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Capza3P70190 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Capza3P70190 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Capza3P70190 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Capza3P70190 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Capza3P70190 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Capza3P70190 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Capza3P70190 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Capza3P70190 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Capza3P70190 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Capza3P70190 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Capza3P70190 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Capza3P70190 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Capza3P70190 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Capza3P70190 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Capza3P70190 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Capza3P70190 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Capza3P70190 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Capza3P70190 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Capza3P70190 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Capza3P70190 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Capza3P70190 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Capza3P70190 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Capza3P70190 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Capza3P70190 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Capza3P70190 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Capza3P70190 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 290.7 ms