Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,89■■■■□ 3,66
Capza3P70190 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Capza3P70190 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Capza3P70190 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Capza3P70190 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Capza3P70190 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Capza3P70190 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,51■■■■□ 3,12
Capza3P70190 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Capza3P70190 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Capza3P70190 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Capza3P70190 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Capza3P70190 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Capza3P70190 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Capza3P70190 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Capza3P70190 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Capza3P70190 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Capza3P70190 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
Capza3P70190 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Capza3P70190 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Capza3P70190 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Capza3P70190 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Capza3P70190 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Capza3P70190 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,22■■■□□ 2,75
Capza3P70190 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Capza3P70190 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Capza3P70190 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Capza3P70190 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Capza3P70190 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Capza3P70190 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Capza3P70190 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Capza3P70190 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Capza3P70190 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Capza3P70190 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Capza3P70190 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Capza3P70190 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Capza3P70190 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Capza3P70190 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Capza3P70190 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Capza3P70190 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Capza3P70190 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Capza3P70190 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Capza3P70190 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Capza3P70190 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Capza3P70190 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Capza3P70190 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Capza3P70190 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Capza3P70190 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Capza3P70190 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Capza3P70190 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Capza3P70190 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Capza3P70190 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Capza3P70190 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Capza3P70190 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Capza3P70190 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Capza3P70190 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Capza3P70190 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Capza3P70190 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Capza3P70190 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Capza3P70190 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Capza3P70190 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Capza3P70190 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Capza3P70190 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Capza3P70190 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Capza3P70190 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Capza3P70190 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Capza3P70190 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Capza3P70190 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Capza3P70190 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Capza3P70190 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Capza3P70190 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Capza3P70190 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Capza3P70190 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Capza3P70190 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Capza3P70190 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Capza3P70190 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Capza3P70190 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Capza3P70190 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Capza3P70190 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Capza3P70190 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Capza3P70190 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Capza3P70190 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Capza3P70190 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Capza3P70190 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Capza3P70190 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Capza3P70190 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Capza3P70190 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Capza3P70190 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Capza3P70190 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Capza3P70190 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Capza3P70190 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Capza3P70190 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Capza3P70190 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Capza3P70190 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Capza3P70190 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Capza3P70190 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Capza3P70190 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Capza3P70190 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Capza3P70190 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Capza3P70190 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Capza3P70190 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms