Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,64■■■■■ 4,74
Otop3Q80UF9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Otop3Q80UF9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Otop3Q80UF9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Otop3Q80UF9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,16■■■■□ 3,86
Otop3Q80UF9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Otop3Q80UF9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,63■■■■□ 3,77
Otop3Q80UF9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,41■■■■□ 3,74
Otop3Q80UF9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,32■■■■□ 3,73
Otop3Q80UF9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Otop3Q80UF9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Otop3Q80UF9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,55
Otop3Q80UF9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,23■■■■□ 3,55
Otop3Q80UF9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Otop3Q80UF9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Otop3Q80UF9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,85■■■■□ 3,49
Otop3Q80UF9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,67■■■■□ 3,46
Otop3Q80UF9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Otop3Q80UF9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Otop3Q80UF9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Otop3Q80UF9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Otop3Q80UF9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Otop3Q80UF9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Otop3Q80UF9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Otop3Q80UF9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Otop3Q80UF9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Otop3Q80UF9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36■■■■□ 3,35
Otop3Q80UF9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Otop3Q80UF9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Otop3Q80UF9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Otop3Q80UF9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Otop3Q80UF9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Otop3Q80UF9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,43■■■■□ 3,26
Otop3Q80UF9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Otop3Q80UF9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Otop3Q80UF9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Otop3Q80UF9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Otop3Q80UF9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Otop3Q80UF9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Otop3Q80UF9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,23■■■■□ 3,23
Otop3Q80UF9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Otop3Q80UF9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Otop3Q80UF9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Otop3Q80UF9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Otop3Q80UF9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Otop3Q80UF9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Otop3Q80UF9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Otop3Q80UF9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Otop3Q80UF9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Otop3Q80UF9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Otop3Q80UF9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Otop3Q80UF9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Otop3Q80UF9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Otop3Q80UF9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Otop3Q80UF9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Otop3Q80UF9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Otop3Q80UF9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Otop3Q80UF9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Otop3Q80UF9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Otop3Q80UF9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Otop3Q80UF9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Otop3Q80UF9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,97■■■■□ 3,03
Otop3Q80UF9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Otop3Q80UF9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Otop3Q80UF9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Otop3Q80UF9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Otop3Q80UF9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Otop3Q80UF9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Otop3Q80UF9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Otop3Q80UF9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Otop3Q80UF9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Otop3Q80UF9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Otop3Q80UF9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Otop3Q80UF9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Otop3Q80UF9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Otop3Q80UF9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,57■■■□□ 2,97
Otop3Q80UF9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Otop3Q80UF9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Otop3Q80UF9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Otop3Q80UF9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Otop3Q80UF9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Otop3Q80UF9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Otop3Q80UF9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Otop3Q80UF9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Otop3Q80UF9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Otop3Q80UF9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Otop3Q80UF9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Otop3Q80UF9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Otop3Q80UF9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Otop3Q80UF9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Otop3Q80UF9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Otop3Q80UF9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Otop3Q80UF9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Otop3Q80UF9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Otop3Q80UF9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Otop3Q80UF9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Otop3Q80UF9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Otop3Q80UF9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32,88■■■□□ 2,85
Otop3Q80UF9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Otop3Q80UF9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms