Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Gm28919A0A087WP35 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Gm28919A0A087WP35 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gm28919A0A087WP35 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Gm28919A0A087WP35 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Gm28919A0A087WP35 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gm28919A0A087WP35 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gm28919A0A087WP35 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gm28919A0A087WP35 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gm28919A0A087WP35 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gm28919A0A087WP35 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Gm28919A0A087WP35 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Gm28919A0A087WP35 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Gm28919A0A087WP35 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gm28919A0A087WP35 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Gm28919A0A087WP35 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Gm28919A0A087WP35 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gm28919A0A087WP35 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gm28919A0A087WP35 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gm28919A0A087WP35 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gm28919A0A087WP35 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Gm28919A0A087WP35 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gm28919A0A087WP35 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Gm28919A0A087WP35 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gm28919A0A087WP35 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gm28919A0A087WP35 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gm28919A0A087WP35 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Gm28919A0A087WP35 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Gm28919A0A087WP35 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gm28919A0A087WP35 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Gm28919A0A087WP35 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gm28919A0A087WP35 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Gm28919A0A087WP35 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gm28919A0A087WP35 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gm28919A0A087WP35 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gm28919A0A087WP35 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gm28919A0A087WP35 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Gm28919A0A087WP35 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gm28919A0A087WP35 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gm28919A0A087WP35 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm28919A0A087WP35 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm28919A0A087WP35 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Gm28919A0A087WP35 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gm28919A0A087WP35 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gm28919A0A087WP35 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Gm28919A0A087WP35 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gm28919A0A087WP35 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Gm28919A0A087WP35 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gm28919A0A087WP35 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Gm28919A0A087WP35 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gm28919A0A087WP35 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Gm28919A0A087WP35 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gm28919A0A087WP35 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gm28919A0A087WP35 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gm28919A0A087WP35 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gm28919A0A087WP35 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm28919A0A087WP35 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gm28919A0A087WP35 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gm28919A0A087WP35 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gm28919A0A087WP35 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gm28919A0A087WP35 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm28919A0A087WP35 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Gm28919A0A087WP35 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gm28919A0A087WP35 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gm28919A0A087WP35 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gm28919A0A087WP35 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gm28919A0A087WP35 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gm28919A0A087WP35 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gm28919A0A087WP35 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Gm28919A0A087WP35 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gm28919A0A087WP35 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gm28919A0A087WP35 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gm28919A0A087WP35 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gm28919A0A087WP35 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gm28919A0A087WP35 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gm28919A0A087WP35 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gm28919A0A087WP35 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gm28919A0A087WP35 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gm28919A0A087WP35 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm28919A0A087WP35 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm28919A0A087WP35 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm28919A0A087WP35 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm28919A0A087WP35 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm28919A0A087WP35 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gm28919A0A087WP35 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gm28919A0A087WP35 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm28919A0A087WP35 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm28919A0A087WP35 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm28919A0A087WP35 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm28919A0A087WP35 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm28919A0A087WP35 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm28919A0A087WP35 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm28919A0A087WP35 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm28919A0A087WP35 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm28919A0A087WP35 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm28919A0A087WP35 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm28919A0A087WP35 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm28919A0A087WP35 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
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