Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC57.68■■■■■ 6.82
Myo5cE9Q1F5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
Myo5cE9Q1F5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
Myo5cE9Q1F5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
Myo5cE9Q1F5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
Myo5cE9Q1F5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49.32■■■■■ 5.49
Myo5cE9Q1F5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
Myo5cE9Q1F5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
Myo5cE9Q1F5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Myo5cE9Q1F5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
Myo5cE9Q1F5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC48.04■■■■■ 5.28
Myo5cE9Q1F5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Myo5cE9Q1F5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
Myo5cE9Q1F5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Myo5cE9Q1F5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Myo5cE9Q1F5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC46.5■■■■■ 5.03
Myo5cE9Q1F5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
Myo5cE9Q1F5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Myo5cE9Q1F5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
Myo5cE9Q1F5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC46.01■■■■■ 4.96
Myo5cE9Q1F5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Myo5cE9Q1F5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Myo5cE9Q1F5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Myo5cE9Q1F5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Myo5cE9Q1F5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
Myo5cE9Q1F5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Myo5cE9Q1F5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
Myo5cE9Q1F5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Myo5cE9Q1F5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Myo5cE9Q1F5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Myo5cE9Q1F5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Myo5cE9Q1F5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Myo5cE9Q1F5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
Myo5cE9Q1F5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
Myo5cE9Q1F5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Myo5cE9Q1F5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Myo5cE9Q1F5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Myo5cE9Q1F5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Myo5cE9Q1F5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Myo5cE9Q1F5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.65
Myo5cE9Q1F5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Myo5cE9Q1F5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Myo5cE9Q1F5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Myo5cE9Q1F5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Myo5cE9Q1F5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
Myo5cE9Q1F5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Myo5cE9Q1F5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Myo5cE9Q1F5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Myo5cE9Q1F5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
Myo5cE9Q1F5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Myo5cE9Q1F5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Myo5cE9Q1F5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Myo5cE9Q1F5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Myo5cE9Q1F5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Myo5cE9Q1F5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Myo5cE9Q1F5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Myo5cE9Q1F5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Myo5cE9Q1F5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Myo5cE9Q1F5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Myo5cE9Q1F5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
Myo5cE9Q1F5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
Myo5cE9Q1F5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Myo5cE9Q1F5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Myo5cE9Q1F5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
Myo5cE9Q1F5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Myo5cE9Q1F5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Myo5cE9Q1F5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Myo5cE9Q1F5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Myo5cE9Q1F5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Myo5cE9Q1F5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Myo5cE9Q1F5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Myo5cE9Q1F5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Myo5cE9Q1F5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Myo5cE9Q1F5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
Myo5cE9Q1F5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Myo5cE9Q1F5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Myo5cE9Q1F5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Myo5cE9Q1F5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Myo5cE9Q1F5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Myo5cE9Q1F5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Myo5cE9Q1F5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Myo5cE9Q1F5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Myo5cE9Q1F5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Myo5cE9Q1F5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Myo5cE9Q1F5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Myo5cE9Q1F5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Myo5cE9Q1F5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Myo5cE9Q1F5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Myo5cE9Q1F5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Myo5cE9Q1F5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Myo5cE9Q1F5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Myo5cE9Q1F5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Myo5cE9Q1F5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Myo5cE9Q1F5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Myo5cE9Q1F5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Myo5cE9Q1F5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Myo5cE9Q1F5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
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