Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
Sema3eP70275 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Sema3eP70275 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Sema3eP70275 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Sema3eP70275 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Sema3eP70275 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Sema3eP70275 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sema3eP70275 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Sema3eP70275 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Sema3eP70275 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sema3eP70275 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sema3eP70275 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Sema3eP70275 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Sema3eP70275 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Sema3eP70275 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Sema3eP70275 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Sema3eP70275 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Sema3eP70275 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Sema3eP70275 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Sema3eP70275 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Sema3eP70275 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Sema3eP70275 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Sema3eP70275 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Sema3eP70275 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sema3eP70275 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sema3eP70275 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Sema3eP70275 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Sema3eP70275 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Sema3eP70275 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sema3eP70275 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Sema3eP70275 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Sema3eP70275 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sema3eP70275 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Sema3eP70275 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Sema3eP70275 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Sema3eP70275 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Sema3eP70275 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sema3eP70275 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sema3eP70275 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sema3eP70275 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sema3eP70275 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sema3eP70275 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sema3eP70275 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sema3eP70275 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sema3eP70275 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sema3eP70275 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Sema3eP70275 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Sema3eP70275 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Sema3eP70275 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sema3eP70275 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sema3eP70275 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sema3eP70275 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Sema3eP70275 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sema3eP70275 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Sema3eP70275 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sema3eP70275 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sema3eP70275 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sema3eP70275 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Sema3eP70275 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Sema3eP70275 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sema3eP70275 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sema3eP70275 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Sema3eP70275 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sema3eP70275 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Sema3eP70275 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Sema3eP70275 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Sema3eP70275 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sema3eP70275 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sema3eP70275 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sema3eP70275 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sema3eP70275 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sema3eP70275 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sema3eP70275 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sema3eP70275 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sema3eP70275 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sema3eP70275 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sema3eP70275 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sema3eP70275 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sema3eP70275 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sema3eP70275 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sema3eP70275 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sema3eP70275 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Sema3eP70275 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sema3eP70275 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Sema3eP70275 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sema3eP70275 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sema3eP70275 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sema3eP70275 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sema3eP70275 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sema3eP70275 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sema3eP70275 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Sema3eP70275 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sema3eP70275 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sema3eP70275 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sema3eP70275 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Sema3eP70275 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sema3eP70275 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Sema3eP70275 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sema3eP70275 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Sema3eP70275 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms