Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,17■■■■■ 4,82
Sema3eP70275 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,75■■■■■ 4,27
Sema3eP70275 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Sema3eP70275 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,49■■■■□ 3,91
Sema3eP70275 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,13■■■■□ 3,85
Sema3eP70275 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,6■■■■□ 3,77
Sema3eP70275 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Sema3eP70275 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Sema3eP70275 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Sema3eP70275 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Sema3eP70275 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Sema3eP70275 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,76■■■■□ 3,64
Sema3eP70275 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Sema3eP70275 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,34■■■■□ 3,57
Sema3eP70275 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Sema3eP70275 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Sema3eP70275 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Sema3eP70275 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,46■■■■□ 3,43
Sema3eP70275 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Sema3eP70275 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Sema3eP70275 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,21■■■■□ 3,39
Sema3eP70275 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Sema3eP70275 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Sema3eP70275 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Sema3eP70275 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Sema3eP70275 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Sema3eP70275 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Sema3eP70275 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Sema3eP70275 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Sema3eP70275 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Sema3eP70275 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,72■■■■□ 3,31
Sema3eP70275 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Sema3eP70275 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,63■■■■□ 3,29
Sema3eP70275 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Sema3eP70275 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Sema3eP70275 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Sema3eP70275 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Sema3eP70275 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Sema3eP70275 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Sema3eP70275 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Sema3eP70275 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Sema3eP70275 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Sema3eP70275 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Sema3eP70275 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Sema3eP70275 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Sema3eP70275 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Sema3eP70275 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,57■■■■□ 3,13
Sema3eP70275 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Sema3eP70275 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Sema3eP70275 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Sema3eP70275 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Sema3eP70275 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,16■■■■□ 3,06
Sema3eP70275 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Sema3eP70275 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,05
Sema3eP70275 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Sema3eP70275 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Sema3eP70275 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Sema3eP70275 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Sema3eP70275 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Sema3eP70275 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Sema3eP70275 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Sema3eP70275 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Sema3eP70275 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Sema3eP70275 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Sema3eP70275 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Sema3eP70275 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Sema3eP70275 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Sema3eP70275 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Sema3eP70275 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Sema3eP70275 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Sema3eP70275 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Sema3eP70275 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Sema3eP70275 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sema3eP70275 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sema3eP70275 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Sema3eP70275 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Sema3eP70275 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Sema3eP70275 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Sema3eP70275 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Sema3eP70275 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Sema3eP70275 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Sema3eP70275 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Sema3eP70275 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Sema3eP70275 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Sema3eP70275 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Sema3eP70275 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Sema3eP70275 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Sema3eP70275 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sema3eP70275 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Sema3eP70275 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Sema3eP70275 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,89
Sema3eP70275 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Sema3eP70275 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Sema3eP70275 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Sema3eP70275 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Sema3eP70275 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Sema3eP70275 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Sema3eP70275 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Sema3eP70275 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,98■■■□□ 2,87
Sema3eP70275 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms