Protein–RNA interactions for Protein: Q60775

Elf1, ETS-related transcription factor Elf-1, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf1Q60775 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
Elf1Q60775 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Elf1Q60775 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Elf1Q60775 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Elf1Q60775 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Elf1Q60775 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Elf1Q60775 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Elf1Q60775 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Elf1Q60775 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Elf1Q60775 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Elf1Q60775 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Elf1Q60775 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Elf1Q60775 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Elf1Q60775 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Elf1Q60775 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Elf1Q60775 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Elf1Q60775 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Elf1Q60775 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Elf1Q60775 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Elf1Q60775 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Elf1Q60775 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Elf1Q60775 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Elf1Q60775 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Elf1Q60775 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Elf1Q60775 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Elf1Q60775 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Elf1Q60775 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Elf1Q60775 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Elf1Q60775 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Elf1Q60775 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Elf1Q60775 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Elf1Q60775 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Elf1Q60775 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Elf1Q60775 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Elf1Q60775 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Elf1Q60775 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Elf1Q60775 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Elf1Q60775 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Elf1Q60775 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Elf1Q60775 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Elf1Q60775 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Elf1Q60775 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Elf1Q60775 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Elf1Q60775 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Elf1Q60775 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Elf1Q60775 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Elf1Q60775 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Elf1Q60775 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Elf1Q60775 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Elf1Q60775 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Elf1Q60775 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Elf1Q60775 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Elf1Q60775 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Elf1Q60775 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Elf1Q60775 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Elf1Q60775 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Elf1Q60775 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Elf1Q60775 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Elf1Q60775 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Elf1Q60775 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Elf1Q60775 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Elf1Q60775 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Elf1Q60775 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Elf1Q60775 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Elf1Q60775 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Elf1Q60775 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Elf1Q60775 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Elf1Q60775 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Elf1Q60775 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Elf1Q60775 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Elf1Q60775 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Elf1Q60775 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Elf1Q60775 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Elf1Q60775 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Elf1Q60775 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Elf1Q60775 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Elf1Q60775 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Elf1Q60775 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Elf1Q60775 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Elf1Q60775 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Elf1Q60775 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Elf1Q60775 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Elf1Q60775 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Elf1Q60775 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Elf1Q60775 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Elf1Q60775 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Elf1Q60775 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Elf1Q60775 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Elf1Q60775 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Elf1Q60775 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Elf1Q60775 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Elf1Q60775 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Elf1Q60775 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Elf1Q60775 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Elf1Q60775 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Elf1Q60775 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Elf1Q60775 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Elf1Q60775 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Elf1Q60775 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Elf1Q60775 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms