Protein–RNA interactions for Protein: O08796

Eef2k, Eukaryotic elongation factor 2 kinase, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef2kO08796 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Eef2kO08796 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Eef2kO08796 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Eef2kO08796 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Eef2kO08796 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Eef2kO08796 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Eef2kO08796 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Eef2kO08796 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Eef2kO08796 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Eef2kO08796 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Eef2kO08796 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Eef2kO08796 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Eef2kO08796 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Eef2kO08796 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Eef2kO08796 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Eef2kO08796 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Eef2kO08796 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Eef2kO08796 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Eef2kO08796 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Eef2kO08796 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Eef2kO08796 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Eef2kO08796 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Eef2kO08796 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Eef2kO08796 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Eef2kO08796 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Eef2kO08796 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Eef2kO08796 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Eef2kO08796 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Eef2kO08796 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Eef2kO08796 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Eef2kO08796 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Eef2kO08796 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Eef2kO08796 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Eef2kO08796 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Eef2kO08796 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Eef2kO08796 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Eef2kO08796 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Eef2kO08796 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Eef2kO08796 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Eef2kO08796 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Eef2kO08796 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Eef2kO08796 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Eef2kO08796 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Eef2kO08796 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Eef2kO08796 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Eef2kO08796 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Eef2kO08796 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Eef2kO08796 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Eef2kO08796 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Eef2kO08796 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Eef2kO08796 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Eef2kO08796 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Eef2kO08796 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Eef2kO08796 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Eef2kO08796 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Eef2kO08796 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Eef2kO08796 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Eef2kO08796 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Eef2kO08796 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Eef2kO08796 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Eef2kO08796 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Eef2kO08796 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Eef2kO08796 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Eef2kO08796 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Eef2kO08796 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Eef2kO08796 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Eef2kO08796 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Eef2kO08796 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Eef2kO08796 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Eef2kO08796 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Eef2kO08796 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Eef2kO08796 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Eef2kO08796 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Eef2kO08796 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Eef2kO08796 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Eef2kO08796 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Eef2kO08796 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Eef2kO08796 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Eef2kO08796 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Eef2kO08796 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Eef2kO08796 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Eef2kO08796 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Eef2kO08796 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Eef2kO08796 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Eef2kO08796 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Eef2kO08796 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Eef2kO08796 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Eef2kO08796 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Eef2kO08796 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Eef2kO08796 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Eef2kO08796 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Eef2kO08796 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Eef2kO08796 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Eef2kO08796 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Eef2kO08796 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Eef2kO08796 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Eef2kO08796 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Eef2kO08796 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Eef2kO08796 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Eef2kO08796 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms