RNA–Protein interactions for RNA: YOR089C

VPS21, Transcript of Endosomal Rab family GTPase, yeast

Gene VPS21, Length 633 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VPS21	YOR089C	SWT1	Q12104	458 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	USV1	Q12132	391 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	GCN4	P03069	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	SGF29	P25554	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YPT53	P36019	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	SUL1	P38359	859 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	PIH1	P38768	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	CIR1	P42940	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	IRC6	P43615	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	GTB1	Q04924	702 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	TMA16	Q08687	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	PCD1	Q12524	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	SRB8	P25648	1427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	MRP20	P32387	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	LAS21	P40367	830 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	CTR1	P49573	406 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	REG1	Q00816	1014 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	CRT10	Q08226	957 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RCN2	Q12044	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RKI1	Q12189	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	SFI1	Q12369	946 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	MET8	P15807	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	URK1	P27515	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	SIP1	P32578	815 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	BLI1	P35727	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	ESL2	P36168	1195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	MAM1	P40065	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	DJP1	P40564	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RMD8	P43620	662 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	AAD10	P47182	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YIP4	P53093	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	BUD17	P53727	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	MUB1	Q03162	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YKU80	Q04437	629 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	ERG8	P24521	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	CNE1	P27825	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	CDC5	P32562	705 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	NPL6	P32832	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	NFU1	P32860	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	PXA2	P34230	853 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YKL050C	P35736	922 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	GMH1	P36125	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YBR225W	P38321	900 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YHL017W	P38745	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	FLC2	P39719	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	NDC80	P40460	691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	NMA2	P53204	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	TAM41	P53230	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	MDG1	P53885	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YSA1	Q01976	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	ARP9	Q05123	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	VCX1	Q99385	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	LTE1	P07866	1435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	AAC1	P04710	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	OCA4	P25366	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	PEX5	P35056	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	GLG1	P36143	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	PPS1	P38148	807 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	RTS1	P38903	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	SLZ1	P40167	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	UBX6	P47049	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	SPC98	P53540	846 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	TAF11	Q04226	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	MFB1	Q04922	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	TCO89	Q08921	799 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	BAG7	Q12128	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS21	YOR089C	NMD4	Q12129	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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