RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C SLC1P33333 303 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C HES1P35843 434 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C SCO2P38072 301 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C EXO84P38261 753 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C ERV46P39727 415 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C PFK26P40433 827 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C DJP1P40564 432 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C ORC5P50874 479 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C YPR003CP53394 754 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C TY2A-DR2Q03483 438 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C ATG23Q06671 453 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C SWA2Q06677 668 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C VAM6Q07468 1049 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C PSR2Q07949 397 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C LYS21Q12122 440 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C TY2A-BQ12260 438 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C TY2A-OR2Q12293 438 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C TY2A-DR1Q12392 438 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C TY2A-OR1Q12439 438 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C TY2A-DR3Q99303 438 aa2.78□□□□□ -1.96
RPB11YOL005C CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C SNF1P06782 633 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YML003WP0CF16 290 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C SPO16P17122 198 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C RPT3P33298 428 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C BUD16P39988 312 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C LTP1P40347 161 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C RIC1P40395 1056 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C ASG1P40467 964 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YIL024CP40543 189 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C BNA3P47039 444 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C ASE1P50275 885 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YML131WQ03102 365 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C CRN1Q06440 651 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C TRM8Q12009 286 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C CRC1Q12289 327 aa2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C ERG27Q12452 347 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C MAK32P23060 363 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C DPB3P27344 201 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C UBP7P40453 1071 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C MSY1P48527 492 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C CTF18P49956 741 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C DCP2P53550 970 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YNL144CP53907 740 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YMR018WQ04364 514 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C VID22Q05934 901 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YLR049CQ12110 428 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C BAG7Q12128 409 aa2.76□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C TFC3P34111 1160 aa2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C LHS1P36016 881 aa2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C ADE17P38009 592 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C JHD1P40034 492 aa2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C BNA1P47096 177 aa2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C GLO1P50107 326 aa2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C PSP1P50896 841 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C PDR8Q06149 701 aa2.75□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C GAL4P04386 881 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C MRP2P10663 115 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C ERG8P24521 451 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YSP3P25036 478 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C CDC15P27636 974 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C SOF1P33750 489 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C UBP13P38187 747 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C MRX1P40050 688 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C GAT1P43574 510 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C PFA5Q03289 374 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C SNO4Q04902 237 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C MCH4Q08268 501 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C SSP2Q08646 371 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C HSP32Q08992 237 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C NUS1Q12063 375 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C GET3Q12154 354 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C HER1Q12276 1246 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C RRI1Q12468 440 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YOR019WQ99248 730 aa2.74□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C PCT1P13259 424 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C RER1P25560 188 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C SSH4P32343 579 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C SRB5P32585 307 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C ARN1P38731 627 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C AXL2P38928 823 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C PSD1P39006 500 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YER010CP40011 234 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C VRG4P40107 337 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C MNT3P40549 630 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YJL107CP42947 387 aa2.73□□□□□ -1.97
RPB11YOL005C YPT11P48559 417 aa2.73□□□□□ -1.97
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