RNA–Protein interactions for RNA: YNL035C

YNL035C, Transcript of Nuclear protein of unknown function, yeast

Gene YNL035C, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL035C	YNL035C	HRD3	Q05787	833 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	IRC10	Q08118	586 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	MET8	P15807	274 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	PMA2	P19657	947 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	AAD3	P25612	363 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	LAC1	P28496	418 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YMC1	P32331	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	TFC3	P34111	1160 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	HES1	P35843	434 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	DJP1	P40564	432 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YKU80	Q04437	629 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	CRN1	Q06440	651 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SDH5	Q08230	162 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ULA1	Q12059	462 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	HUA2	Q12134	243 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RTP1	Q12751	981 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YSP3	P25036	478 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SRB5	P32585	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	JNM1	P36224	373 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YEL020C	P39994	560 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	JHD1	P40034	492 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	UBP7	P40453	1071 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	IME4	P41833	600 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	MSY1	P48527	492 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	TIM10	P87108	93 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SWA2	Q06677	668 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
YNL035C	YNL035C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SPO11	P23179	398 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	PRE8	P23639	250 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SLZ1	P40167	298 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YJL043W	P47053	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	INN1	P53901	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	MUB1	Q03162	620 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	CYK3	Q07533	885 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	BAG7	Q12128	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SUT2	Q12286	268 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YCK1	P23291	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SGF29	P25554	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YBL029W	P38201	376 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RTS1	P38903	757 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	EXO1	P39875	702 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	OPT1	P40897	799 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	TDA10	P42938	290 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SWP82	P43554	623 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	AAD10	P47182	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YAT1	P80235	687 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	RPN13	O13563	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	MRP7	P12687	371 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	PCT1	P13259	424 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	CDC15	P27636	974 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	YIL166C	P40445	542 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	STU2	P46675	888 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	DSD1	P53095	428 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	FMP30	Q02883	468 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	NGL3	Q03210	505 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	MFB1	Q04922	465 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	CIR2	Q08822	631 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	PTC6	P25646	442 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	RPC34	P32910	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	MAL33	P38157	468 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	YBR225W	P38321	900 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL035C	YNL035C	CIR1	P42940	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.3 ms