RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W RFX1P48743 811 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W SAP4P53036 818 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W YPL034WQ03083 165 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W FAR8Q05040 523 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W HRD3Q05787 833 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W TPO1Q07824 586 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W LOT6Q07923 191 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W YLL056CQ12177 298 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W APM4Q99186 491 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W UBR2Q07963 1872 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W TAO3P40468 2376 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR196WYMR196W STE13P33894 931 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MRPL7P36519 292 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W CKB2P38930 258 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W FHL1P39521 936 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W CDC1P40986 491 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MAF1P41910 395 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W TAH11P47112 604 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W KTR6P54070 446 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RRN5Q02983 363 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SKY1Q03656 742 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PBS2P08018 668 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W KAR4P25583 335 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YBR032WP38223 100 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W CRP1P38845 465 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SCC4P40090 624 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SEC28P40509 296 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MND2P40577 368 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W OPT1P40897 799 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W KXD1P53158 218 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PEX31P53203 462 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YMR102CQ03177 834 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W INP2Q03824 705 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W KRE28Q04431 385 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SDH5Q08230 162 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W HOM2P13663 365 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W CDC10P25342 322 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ADK2P26364 225 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W URA7P28274 579 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YME2P32843 850 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PTH2P34222 208 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YBR056WP38081 501 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SPC97P38863 823 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ECL1P48235 211 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YPR003CP53394 754 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W INA17Q02888 182 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W FDC1Q03034 503 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W AIM32Q04689 311 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ADF1Q2V2Q1 113 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data4.76□□□□□ -1.65not detected
YMR196WYMR196W ARG81P05085 880 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YBP1P38315 674 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SMF2P38778 549 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W GUF1P46943 645 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SSN8P47821 323 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YMR160WQ03823 816 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data4.76□□□□□ -1.65not detected
YMR196WYMR196W GPM3Q12326 303 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W STB3Q12427 513 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W NPP1P25353 742 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W GUT1P32190 709 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MET4P32389 672 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SLX5P32828 619 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W GCS1P35197 352 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W CUE2P36075 443 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ALG14P38242 237 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PPE1P38796 400 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ZIM17P42844 174 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SLT2Q00772 484 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ARA2Q04212 335 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YML083CQ04526 418 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W TAF10Q12030 206 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W LCB4Q12246 624 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W HRT3Q12347 344 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ATP4P05626 244 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W DSF1P0CX08 502 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YNR073CP0CX09 502 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SEC14P24280 304 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RFS1P38234 210 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W YBR062CP38239 180 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W FSH1P38777 243 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W MRX1P40050 688 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W TGL3P40308 642 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W TDA10P42938 290 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W APS3P47064 194 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W RTA1P53047 317 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W ARP9Q05123 467 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W BUD7Q08754 746 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data4.75□□□□□ -1.65not detected
YMR196WYMR196W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W CCP1P00431 361 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR196WYMR196W PMI40P29952 429 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.7 ms