RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	DPB3	P27344	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	EXO84	P38261	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	ERV46	P39727	415 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	UBP7	P40453	1071 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	ASG1	P40467	964 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	IML2	P47031	731 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	ASE1	P50275	885 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	CRC1	Q12289	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	JHD1	P40034	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	YPR003C	P53394	754 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TMA16	Q08687	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	PCD1	Q12524	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	PHM8	P40025	321 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	YIL024C	P40543	189 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	CTF18	P49956	741 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	GTR1	Q00582	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	SWA2	Q06677	668 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	ARN1	P38731	627 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	CFD1	P40558	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YJL107C	P42947	387 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	GLO1	P50107	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YSP3	P25036	478 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	CNS1	P33313	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SLC1	P33333	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	GEX2	P36173	615 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	PDR8	Q06149	701 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	TRM8	Q12009	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YCR006C	P25350	157 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	TFC3	P34111	1160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	RIC1	P40395	1056 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	MNT3	P40549	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	TFC6	Q06339	672 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	CRN1	Q06440	651 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	PFA4	Q12006	378 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YLR302C	O13544	120 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	PCT1	P13259	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	OCT1	P35999	772 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	LHS1	P36016	881 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	FLO5	P38894	1075 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	MRX1	P40050	688 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	VID22	Q05934	901 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	CDC15	P27636	974 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	CDC1	P40986	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	BNA1	P47096	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	FCP1	Q03254	732 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	NUS1	Q12063	375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	RRI1	Q12468	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YPR089W	O13585	888 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	GAL4	P04386	881 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	CNA1	P23287	553 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SRB5	P32585	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SCO2	P38072	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	GAT1	P43574	510 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YNL144C	P53907	740 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SEC5	P89102	971 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	VTC3	Q02725	835 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	YML131W	Q03102	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	MCH4	Q08268	501 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SPC97	P38863	823 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	UBP8	P50102	471 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	REG1	Q00816	1014 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	RGT2	Q12300	763 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	ICT1	Q12385	394 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	ERG8	P24521	451 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	RER1	P25560	188 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	RRN3	P36070	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KAR5	YMR065W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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