RNA–Protein interactions for RNA: YLR007W

NSE1, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE1, Length 1,011 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE1	YLR007W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	TRM8	Q12009	286 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	ISA2	Q12425	185 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	CTT1	P06115	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	CDC16	P09798	840 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	NPL6	P32832	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	MRPL36	P36531	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YEL020C	P39994	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	THI6	P41835	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SAE2	P46946	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	MTF2	P10849	440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	CKA1	P15790	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	MAM1	P40065	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	IMO32	P53219	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RAD33	Q04231	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	MFB1	Q04922	465 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	COX17	Q12287	69 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	BIK1	P11709	440 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PMS1	P14242	873 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PMA2	P19657	947 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	DMC1	P25453	334 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	ADY2	P25613	283 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	URK1	P27515	501 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	GEX2	P36173	615 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PIH1	P38768	344 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PSD1	P39006	500 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	BUD16	P39988	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YER010C	P40011	234 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	LYS14	P40971	790 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	BST1	P43571	1029 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YNR061C	P53747	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YNL058C	P53947	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	VPS9	P54787	451 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SEC5	P89102	971 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	HRD3	Q05787	833 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	AAC1	P04710	309 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	WHI2	P12611	486 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	MNE1	P24720	663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	MDL1	P33310	695 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	YBR225W	P38321	900 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	ERC1	P38767	581 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	MTG2	P38860	518 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	YHR218W	P38899	603 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	YGR079W	P53249	370 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	CIK1	Q01649	594 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	RMT2	Q03305	412 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	WAR1	Q03631	944 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	ULA1	Q12059	462 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	LCB4	Q12246	624 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	PET122	P10355	254 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	CNS1	P33313	385 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	LOT5	P34234	306 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	NPR3	P38742	1146 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	YJL068C	P40363	299 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	ZAP1	P47043	880 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	CEX1	Q12453	761 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	GCN4	P03069	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	MET17	P06106	444 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	SGF29	P25554	259 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	PEX2	P32800	271 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NSE1	YLR007W	PPZ2	P33329	710 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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