RNA–Protein interactions for RNA: YJL119C

YJL119C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL119C, Length 324 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL119C	YJL119C	PXL1	P36166	706 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	ERV46	P39727	415 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	YNL144C	P53907	740 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	NUP53	Q03790	475 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	SWF1	Q04629	336 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	CIR2	Q08822	631 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	SWT1	Q12104	458 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	YUR1	P26725	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	FLO5	P38894	1075 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	SPC72	P39723	622 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	ACA1	P39970	489 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	YIR016W	P40572	265 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	ZAP1	P47043	880 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	PIG1	Q06216	648 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	MCH4	Q08268	501 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	MSM1	P22438	575 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	ATO2	P32907	282 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	PTH2	P34222	208 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	PUG1	P40100	303 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	STB2	P46679	850 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	VPS25	P47142	202 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	UBX4	P54730	416 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	YLR281C	Q05863	155 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	SRL1	Q08673	210 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YJL119C	YJL119C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	MRX1	P40050	688 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	UBP7	P40453	1071 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	CDC1	P40986	491 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YPT11	P48559	417 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	ASE1	P50275	885 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	ECI1	Q05871	280 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	POS5	Q06892	414 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	VAM6	Q07468	1049 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	BUD7	Q08754	746 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	PFA4	Q12006	378 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	GAL4	P04386	881 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YCR006C	P25350	157 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	XRS2	P33301	854 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	LHS1	P36016	881 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	PSF2	P40359	213 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YPR003C	P53394	754 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	MRPL13	Q02204	264 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	GSH2	Q08220	491 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	NUC1	P08466	329 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YCL049C	P25577	312 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	CDC15	P27636	974 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	TFC3	P34111	1160 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	RKM3	P38222	552 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	SCS3	P53012	380 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	TAM41	P53230	385 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	CAC2	Q04199	468 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	BLS1	Q06071	122 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	SWA2	Q06677	668 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	SNA4	Q07549	140 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YOL057W	Q08225	711 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	DSE3	Q08729	430 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	RAD16	P31244	790 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YBR138C	P38277	524 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	VPS41	P38959	992 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	PCL6	P40038	420 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YLR455W	Q06188	304 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	GRS2	Q06817	618 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	PSR2	Q07949	397 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.3	□□□□□ -1.88	not detected
YJL119C	YJL119C	MTF2	P10849	440 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	PCT1	P13259	424 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.29	□□□□□ -1.88	not detected
YJL119C	YJL119C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	ERR3	P42222	437 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	TPK1	P06244	397 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	YSP3	P25036	478 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	EXO84	P38261	753 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YJL119C	YJL119C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.8 ms