RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	AQY1	P0CD91	305 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	MDM10	P18409	493 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	MRPL9	P31334	269 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	GDA1	P32621	518 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	ERC1	P38767	581 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	EXO1	P39875	702 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	NDE1	P40215	560 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	LAS21	P40367	830 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	ESL1	P40456	1118 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	NPA3	P47122	385 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	WAR1	Q03631	944 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	PSK2	Q08217	1101 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	PCL8	Q08966	492 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	NBP2	Q12163	236 aa		3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	SRB5	P32585	307 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	HES1	P35843	434 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	HOT13	P36078	116 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	MTG2	P38860	518 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	UBP7	P40453	1071 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	DJP1	P40564	432 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	LYS14	P40971	790 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	YSA1	Q01976	231 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	RAD33	Q04231	177 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	YML053C	Q04978	212 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	HRD3	Q05787	833 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	NUS1	Q12063	375 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	SKM1	Q12469	655 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VMA10	YHR039C-A	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	COX1	P00401	534 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	INH1	P01097	85 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MET8	P15807	274 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	NUP1	P20676	1076 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YSP3	P25036	478 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SIP1	P32578	815 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RPC34	P32910	317 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	TDA10	P42938	290 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	AAD10	P47182	288 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MSY1	P48527	492 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	COG2	P53271	262 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	INN1	P53901	409 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	ENT4	Q07872	247 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YPL191C	Q08930	360 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	BAG7	Q12128	409 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	TFC3	P34111	1160 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	ALY1	P36117	915 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	OPT1	P40897	799 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YJL043W	P47053	257 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SRB7	P47822	140 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MUB1	Q03162	620 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RIM13	Q03792	727 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SEG1	Q04279	960 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	PLM2	Q04383	521 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	PCT1	P13259	424 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	APN1	P22936	367 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MBR1	P23493	339 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	LAC1	P28496	418 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	PHM8	P40025	321 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SLZ1	P40167	298 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	IME4	P41833	600 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RAD30	Q04049	632 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YOR111W	Q99210	232 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YOR019W	Q99248	730 aa		3.38	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MRP7	P12687	371 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SGF29	P25554	259 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	GSY2	P27472	705 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	JNM1	P36224	373 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SWP82	P43554	623 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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