RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	COT1	P32798	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PEX28	P38848	579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	HXT7	P39004	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	QDR1	P40475	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	FET5	P43561	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
MSC7	YHR039C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YGR122W	P53272	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RCF2	P53721	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	DXO1	Q06349	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	NSI1	Q12457	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	MHP1	P43638	1398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	CAN1	P04817	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	CDC9	P04819	755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	GPA1	P08539	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	APA2	P22108	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RPD3	P32561	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	MRX3	P38172	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YBR225W	P38321	900 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SDH8	P38345	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YIL001W	P40560	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	ILM1	P47155	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	HFM1	P51979	1187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YGR127W	P53275	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	REC102	Q02721	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	HER2	Q03557	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YAP6	Q03935	383 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RAD30	Q04049	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	GTO3	Q04806	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	GTB1	Q04924	702 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	DFG5	Q05031	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PUS9	Q12069	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RAD7	P06779	565 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MSS18	P08593	268 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YCR101C	P25607	182 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	HSP30	P25619	332 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PIK1	P39104	1066 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MRX1	P40050	688 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SLM1	P40485	686 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YJR056C	P47115	236 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GTO1	P48239	356 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GNP1	P48813	663 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PUS6	P53294	404 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GYL1	Q04322	720 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	TIP41	Q12199	356 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	HER1	Q12276	1246 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NTO1	Q12311	748 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	IES3	Q12345	250 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PNS1	Q12412	539 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GRX6	Q12438	231 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ARP6	Q12509	438 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GCN2	P15442	1659 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GAL4	P04386	881 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
MSC7	YHR039C	SRD1	P09007	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CKA1	P15790	372 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CLB4	P24871	460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GEX1	P25596	615 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CTF13	P35203	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	DID4	P36108	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	HMT1	P38074	348 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	REV7	P38927	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	UBP7	P40453	1071 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MAL11	P53048	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YGR042W	P53227	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	COQ6	P53318	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	VAC7	P53950	1165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	OPI10	Q08202	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	AKR2	Q12013	749 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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