RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W APA1P16550 321 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W SFL1P20134 766 aa9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W EPT1P22140 391 aa9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W SPS19P32573 292 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W SMF1P38925 575 aa9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W CEM1P39525 442 aa9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W SLX8P40072 274 aa9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W YMR160WQ03823 816 aa9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data9.04□□□□□ -0.96not detected
CPD1YGR247W SLY1P22213 666 aa9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W ECM2P38241 364 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W FLC2P39719 783 aa9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W CFD1P40558 293 aa9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W VPS75P53853 264 aa9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W EMI1Q04406 187 aa9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W STP3Q05937 343 aa9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W YOL073CQ08232 322 aa9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W ATG9Q12142 997 aa9.04□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W PHO84P25297 587 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W MSP1P28737 362 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W PHO11P35842 467 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W PHO12P38693 467 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W CYC2P38909 366 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W ARG2P40360 574 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W MND2P40577 368 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W RTS3P53289 263 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W ARP9Q05123 467 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W BSC6Q08280 497 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W NRT1Q08485 598 aa9.03□□□□□ -0.96
CPD1YGR247W TUB3P09734 445 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W PMS1P14242 873 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W CLN1P20437 546 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W PTP1P25044 335 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W RNQ1P25367 405 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W PLC1P32383 869 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W GMH1P36125 273 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W RRT2P38332 387 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SAP4P53036 818 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W GND2P53319 492 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SIW14P53965 281 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W DIC1Q06143 298 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YLR001CQ07895 862 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W NHA1Q99271 985 aa9.02□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YBR056W-AI2HB52 66 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W CPA1P07258 411 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YSP3P25036 478 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W ARA1P38115 344 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W DBP8P38719 431 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SET5P38890 526 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SAW1P39735 261 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YAT2P40017 923 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W TES1P41903 349 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SSU1P41930 458 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W MET14Q02196 202 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YDR132CQ03900 495 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W MCP2Q06567 569 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YLL056CQ12177 298 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YDR262WQ12331 272 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W FRE7Q12333 620 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa9.01□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W CTF13P35203 478 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W PCL5P38794 229 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W TIM17P39515 158 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YCK3P39962 524 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W RGI2P40188 164 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W ATG3P40344 310 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W FRE4P53746 719 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YDR278CQ05612 105 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W BUD7Q08754 746 aa9□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W TAF14P35189 244 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W MRPL37P36532 105 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W DED81P38707 554 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W BRO1P48582 844 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SUR7P54003 302 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W ERG5P54781 538 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W CCE1Q03702 353 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W ESC2Q06340 456 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W CDC73Q06697 393 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YDR018CQ12185 396 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YLR149CQ99296 730 aa8.99□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W ERG11P10614 530 aa8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W CDC13P32797 924 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W MRPL10P36520 322 aa8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YML6P51998 286 aa8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W NUP100Q02629 959 aa8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W VHS1Q03785 461 aa8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W SIZ1Q04195 904 aa8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W GUP2Q08929 609 aa8.98□□□□□ -0.97
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