RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W NDD1Q08887 554 aa3.65□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YPL191CQ08930 360 aa3.65□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W Q0010Q9ZZX9 128 aa3.65□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ILV2P07342 687 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W NUC1P08466 329 aa3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W NUP120P35729 1037 aa3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W VBA2P38358 474 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W RPT2P40327 437 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YIL152WP40455 235 aa3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ZAP1P47043 880 aa3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W UBX6P47049 396 aa3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W SUL2Q12325 893 aa3.64□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W APA1P16550 321 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W DBF20P32328 564 aa3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YBR138CP38277 524 aa3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W NPR3P38742 1146 aa3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YAT1P80235 687 aa3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W MRPL13Q02204 264 aa3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W PSR2Q07949 397 aa3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W PFA4Q12006 378 aa3.63□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W SES1P07284 462 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YCR043CP25361 127 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YCL049CP25577 312 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W URK1P27515 501 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W LAC1P28496 418 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W VPS24P36095 224 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ERC1P38767 581 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W SAP185P40856 1058 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W NPA3P47122 385 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ORC5P50874 479 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YGR079WP53249 370 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W GTB1Q04924 702 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ATG23Q06671 453 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W RRI1Q12468 440 aa3.62□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W COX1P00401 534 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W NCP1P16603 691 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W CNA1P23287 553 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W RAD16P31244 790 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W XRS2P33301 854 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ERV46P39727 415 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W SMK1P41808 388 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W TES1P41903 349 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YJL107CP42947 387 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W TAM41P53230 385 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W MLH2Q07980 695 aa3.61□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.6□□□□□ -1.83not detected
NSE4YDL105W SPO16P17122 198 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W PTC6P25646 442 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W HES1P35843 434 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W RTT107P38850 1070 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W DJP1P40564 432 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ERR3P42222 437 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YPT11P48559 417 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ARC35P53731 342 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YNL144CP53907 740 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YDR109CQ04585 715 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W CIA1Q05583 330 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W SSM4P40318 1319 aa3.6□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ATP2P00830 511 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W TPK1P06244 397 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W MTF2P10849 440 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W UBC1P21734 215 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W DPB3P27344 201 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W MSS51P32335 436 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W ARN1P38731 627 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W UME6P39001 836 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W MET30P39014 640 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W BUD16P39988 312 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W IES5P40060 125 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YGR021WP53212 290 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W SWT1Q12104 458 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W BAG7Q12128 409 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W COX17Q12287 69 aa3.59□□□□□ -1.83
NSE4YDL105W PHO2P07269 559 aa3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W LRE1P25579 583 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W PSY4P38193 441 aa3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W FUI1P38196 639 aa3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YIL169CP40442 995 aa3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W ASE1P50275 885 aa3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W VAM6Q07468 1049 aa3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W GSH2Q08220 491 aa3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W NRT1Q08485 598 aa3.58□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W GSH1P32477 678 aa3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W TEF4P36008 412 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W IML2P47031 731 aa3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W MSY1P48527 492 aa3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YGL260WP53056 76 aa3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W DCP2P53550 970 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
NSE4YDL105W YLR281CQ05863 155 aa3.57□□□□□ -1.84
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