RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W THI20Q08224 551 aa10.42□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W SSE2P32590 693 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W UGP1P32861 499 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W WHI3P34761 661 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W GPB2P39717 880 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W AGP3P43548 558 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W ARC35P53731 342 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W REX2P54964 269 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W KIN4Q01919 800 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W GPI17Q04080 534 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W GLO2Q05584 274 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W CDC123Q05791 360 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W GMC2Q06201 188 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W RSC2Q06488 889 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W MUM3Q08750 479 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W NSL1Q12143 216 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W YMR030W-AQ3E760 96 aa10.41□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W ATP6P00854 259 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W MSS18P08593 268 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W PET122P10355 254 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W GCN3P14741 305 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W MSS116P15424 664 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W PTP2P29461 750 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W FRE1P32791 686 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W YBL086CP38177 466 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W RPT2P40327 437 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W VHR1P40522 640 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W SYG1P40528 902 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W YJL132WP47014 750 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W TY4A-JP47023 414 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W ASN2P49090 572 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W GPI1P53306 609 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W BUD32P53323 261 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W HSP31Q04432 237 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W YLL058WQ12198 575 aa10.4□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W CBP1P07252 654 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CLB3P24870 427 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YCL068CP25593 260 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W BRF1P29056 596 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W EAP1P36041 632 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W AIM18P38884 321 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MET18P40469 1032 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MSS2P40990 351 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YJL055WP47044 245 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YMR155WQ03795 547 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YCS4Q06156 1176 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W NRT1Q08485 598 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YLL054CQ12244 843 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W REP1P03871 373 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W BCY1P07278 416 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SPE1P08432 466 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W FBA1P14540 359 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W TEC1P18412 486 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SEC15P22224 910 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W TKL1P23254 680 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MRPL32P25348 183 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W VBA3P25594 458 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W NGG1P32494 702 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W UTR4P32626 227 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W VBA5P36172 582 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W GRS1P38088 690 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CYC2P38909 366 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SEO1P39709 593 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ECM10P39987 644 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MGS1P40151 587 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SEC28P40509 296 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YJL007CP47080 104 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W IMD4P50094 524 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ALT1P52893 592 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YNL115CP53925 644 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W LOT6Q07923 191 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W HER1Q12276 1246 aa10.39□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W FBP1P09201 348 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W INO1P11986 533 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W PMA2P19657 947 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W PHO87P25360 923 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W POL4P25615 582 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W PMI40P29952 429 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SMI1P32566 505 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W REG2P38232 338 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ASG7P46993 209 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ULA1Q12059 462 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ATG34Q12292 412 aa10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W GAL2P13181 574 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RVS161P25343 265 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
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