RNA–Protein interactions for RNA: YOL080C

REX4, Transcript of Putative RNA exonuclease, yeast

Gene REX4, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX4	YOL080C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	ATP4	P05626	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	MSS18	P08593	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	POL3	P15436	1097 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SIR1	P21691	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	MAK32	P23060	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	LTV1	P34078	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	CAB2	P40506	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	CIN1	P40987	1014 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	RGT2	Q12300	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SIP1	P32578	815 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	ERC1	P38767	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	RAD26	P40352	1085 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	IRC7	P43623	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SEC5	P89102	971 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	CRC1	Q12289	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	PDE1	P22434	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	RIT1	P23796	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	PTP2	P29461	750 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	NPA3	P47122	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	VPS4	P52917	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	YNL058C	P53947	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	PIF1	P07271	859 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SPC72	P39723	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	ERV46	P39727	415 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SMC3	P47037	1230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	YAT1	P80235	687 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	GEP3	Q08622	556 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	UBP7	P40453	1071 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YIL024C	P40543	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	TAM41	P53230	385 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YGR079W	P53249	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	ARA2	Q04212	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	SUL2	Q12325	893 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	COX1	P00401	534 aa		4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	MSH1	P25846	959 aa		4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	COQ3	P27680	312 aa		4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	GSH1	P32477	678 aa		4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	ATG21	Q02887	496 aa		4.51	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	PTC6	P25646	442 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YHL041W	P38730	149 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	FLO5	P38894	1075 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	JHD1	P40034	492 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	PFA4	Q12006	378 aa		4.5	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	SGS1	P35187	1447 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	GAL4	P04386	881 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	PET122	P10355	254 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	URK1	P27515	501 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	SWC3	P31376	625 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YBR138C	P38277	524 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	NPR3	P38742	1146 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	MNT3	P40549	630 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	MPS1	P54199	764 aa		4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	LAC1	P28496	418 aa		4.48	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	SWE1	P32944	819 aa		4.48	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	UBX4	P54730	416 aa		4.48	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	STP3	Q05937	343 aa		4.48	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	HER1	Q12276	1246 aa		4.48	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	IME2	P32581	645 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	BYE1	P36106	594 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	PUG1	P40100	303 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	CFD1	P40558	293 aa		4.47	□□□□□ -1.69
REX4	YOL080C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69

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