RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	GRC3	Q07845	632 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	LOT6	Q07923	191 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YEH2	Q07950	538 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	DAS2	Q12084	232 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	REC8	Q12188	680 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	INO1	P11986	533 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	IDI1	P15496	288 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ACE2	P21192	770 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	RAD57	P25301	460 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	POL4	P25615	582 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	DAL80	P26343	269 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ACH1	P32316	526 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	MYO3	P36006	1272 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PXL1	P36166	706 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ERT1	P38140	529 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	EXO5	P38289	585 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	MSR1	P38714	643 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YER130C	P39959	443 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	RTA1	P53047	317 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ZIP2	P53061	704 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PIG1	Q06216	648 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	THI22	Q06490	572 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ADY3	Q07732	790 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	NTG2	Q08214	380 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	MED7	Q08278	222 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ADR1	P07248	1323 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	TRP3	P00937	484 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	GAL1	P04385	528 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ARG81	P05085	880 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	STE12	P13574	688 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ZIP1	P31111	875 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	COQ2	P32378	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YKL077W	P36081	392 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	KAE1	P36132	386 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	GLG1	P36143	616 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	SMF1	P38925	575 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PAC11	P40960	533 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	RTS2	P40962	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ALR2	P43553	858 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YJL055W	P47044	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	AVT1	P47082	602 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YPT11	P48559	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ZRG17	P53735	605 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	TOF1	P53840	1238 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
RRN11	YML043C	MAK10	Q02197	733 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	RMI1	Q02685	241 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	GPI17	Q04080	534 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	VPS38	Q05919	439 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	SEC63	P14906	663 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	STF2	P16965	84 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PHO13	P19881	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PTP1	P25044	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	SFP1	P32432	683 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	MKK2	P32491	506 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
RRN11	YML043C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	TPO5	P36029	618 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ECM31	P38122	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YBR062C	P38239	180 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	APE4	P38821	490 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	MTG2	P38860	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	SER33	P40510	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	RET2	P43621	546 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YJL181W	P46987	611 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	NAS6	P50086	228 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YGR016W	P53209	190 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	OKP1	P53298	406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	COS6	P53344	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RRN11	YML043C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71

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