RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SGO1	Q08490	590 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	PGC1	Q08959	321 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	OCA6	Q12454	224 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	GID7	P25569	745 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YCR051W	P25631	222 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	KIP2	P28743	706 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	MLS1	P30952	554 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SWH1	P35845	1188 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SIW14	P53965	281 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	RPN4	Q03465	531 aa		5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	COX5A	P00424	153 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	GPA2	P10823	449 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	INO1	P11986	533 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	NDI1	P32340	513 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	REV7	P38927	245 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	STN1	P38960	494 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	EXO1	P39875	702 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	HEM14	P40012	539 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	CDC14	Q00684	551 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YMR206W	Q03695	313 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SEG1	Q04279	960 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	NCA2	Q12374	616 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	AMS1	P22855	1083 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	MIH1	P23748	554 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TEP1	P53916	434 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	PML39	Q03760	334 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TMN2	Q04562	672 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	LDB18	Q07887	179 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	NDD1	Q08887	554 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	FLC1	Q08967	793 aa		5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TAO3	P40468	2376 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TGL4	P36165	910 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.79	□□□□□ -1.48	not detected
AMD1	YML035C	TDA10	P42938	290 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YTP1	P53584	459 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	IPI3	P53877	555 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	GTR1	Q00582	310 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YCS4	Q06156	1176 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YLR177W	Q06251	628 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ALR1	Q08269	859 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	DAP1	Q12091	152 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.79	□□□□□ -1.48	not detected
AMD1	YML035C	MRPL8	P22353	238 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	RRN3	P36070	627 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ETR1	P38071	380 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	UBP7	P40453	1071 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YNR063W	P53749	607 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	VHS3	Q08438	674 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SLD7	Q08457	257 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	LDB17	Q12342	491 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	GAL11	P19659	1081 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SIR1	P21691	654 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YCL068C	P25593	260 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	BEM3	P32873	1128 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	COY1	P34237	679 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SQT1	P35184	431 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	FZO1	P38297	855 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	AMA1	P50082	593 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YNL058C	P53947	316 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	RSC4	Q02206	625 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	OSW1	Q08692	278 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	CLN1	P20437	546 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	DAL81	P21657	970 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	KIN3	P22209	435 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ERP5	P38819	212 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	DMA1	P38823	416 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YFL012W	P43580	148 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	EFM6	P53970	246 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TFB2	Q02939	513 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	CDC123	Q05791	360 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	RSC2	Q06488	889 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RAM1	P22007	431 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	MSH2	P25847	964 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms