RNA–Protein interactions for RNA: YJR083C

ACF4, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene ACF4, Length 930 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACF4	YJR083C	BST1	P43571	1029 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	UBX6	P47049	396 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	YLR111W	Q12528	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	RTC1	Q08281	1341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	MRPL36	P36531	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	FTH1	P38310	465 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	SPC97	P38863	823 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	VPS8	P39702	1274 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	UBX4	P54730	416 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	YAT1	P80235	687 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ACF4	YJR083C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	CLB4	P24871	460 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	ERC1	P38767	581 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	SPC72	P39723	622 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	PCI8	P40512	444 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	MNT3	P40549	630 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	IRC7	P43623	340 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	ZAP1	P47043	880 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	IMA1	P53051	589 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YGR079W	P53249	370 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	RSC9	Q03124	581 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	IOC4	Q04213	475 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	LAC1	P28496	418 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	NUP120	P35729	1037 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	ASK1	P35734	292 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	JHD1	P40034	492 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	PUG1	P40100	303 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	NPA3	P47122	385 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	TRS130	Q03660	1102 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	COX1	P00401	534 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	MSM1	P22438	575 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	PTC6	P25646	442 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	COQ3	P27680	312 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	MSS51	P32335	436 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	PTH2	P34222	208 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	PXL1	P36166	706 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	ACA1	P39970	489 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	PSF2	P40359	213 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	TPM2	P40414	161 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	TAM41	P53230	385 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	GTB1	Q04924	702 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	RAD34	Q06665	692 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	CRC1	Q12289	327 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	SUL2	Q12325	893 aa		3.31	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	BIK1	P11709	440 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	MAK32	P23060	363 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	URK1	P27515	501 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	CIN1	P40987	1014 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	BLS1	Q06071	122 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	THI3	Q07471	609 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	NUC1	P08466	329 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	RAD16	P31244	790 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	GSH1	P32477	678 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	HES1	P35843	434 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YBR138C	P38277	524 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	NPR3	P38742	1146 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	DJP1	P40564	432 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	ERR3	P42222	437 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	ORC5	P50874	479 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	MRPL13	Q02204	264 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	ATG23	Q06671	453 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	SPO16	P17122	198 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YCL049C	P25577	312 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	YIL024C	P40543	189 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	CFD1	P40558	293 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	STP3	Q05937	343 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	SWT1	Q12104	458 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	BAG7	Q12128	409 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ACF4	YJR083C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88

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