RNA–Protein interactions for RNA: YHR148W

IMP3, Transcript of Component of the SSU processome, yeast

Gene IMP3, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IMP3	YHR148W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	BSP1	Q06604	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	PCD1	Q12524	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	COX1	P00401	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	BNA1	P47096	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	GTR1	Q00582	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	GTB1	Q04924	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	APN1	P22936	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	MAK32	P23060	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	BEM3	P32873	1128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	GEX2	P36173	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	APD1	P38281	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	NPR3	P38742	1146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	UBP7	P40453	1071 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	CIR1	P42940	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	ATP23	P53722	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	RIM13	Q03792	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	PSR2	Q07949	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	COX17	Q12287	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	HES1	P35843	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	SMK1	P41808	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	AAT1	Q01802	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	LAC1	P28496	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	SWC3	P31376	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	GSH1	P32477	678 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YPT53	P36019	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	FTH1	P38310	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	ERV46	P39727	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	SKP2	P42843	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YAT1	P80235	687 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	BI2	P03873	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	MDM10	P18409	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	XRS2	P33301	854 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	PSY4	P38193	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	CTF18	P49956	741 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YML122C	Q03207	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	SEG1	Q04279	960 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	SSM4	P40318	1319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YSP3	P25036	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	MRPL36	P36531	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	MSY1	P48527	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	COG1	P53079	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YML131W	Q03102	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TPO3	Q06451	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TRM8	Q12009	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IMP3	YHR148W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	TPK1	P06244	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	PTC6	P25646	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	CIN1	P40987	1014 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	NMD5	P46970	1048 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	UBX6	P47049	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	RSC9	Q03124	581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	VID22	Q05934	901 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	ORM2	Q06144	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	ATG23	Q06671	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	PCT1	P13259	424 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	YPR003C	P53394	754 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	IRC3	Q06683	689 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	SWT1	Q12104	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IMP3	YHR148W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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