RNA–Protein interactions for RNA: YHR136C

SPL2, Transcript of Protein with similarity to cyclin-dependent kinase inhibitors, yeast

Gene SPL2, Length 447 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPL2	YHR136C	AIM39	Q08223	395 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	VHS3	Q08438	674 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YPR027C	Q12079	277 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	EMP46	Q12396	444 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	KAR4	P25583	335 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	VBA3	P25594	458 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	RAD27	P26793	382 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	PEX2	P32800	271 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	CSE2	P33308	149 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	VBA5	P36172	582 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
SPL2	YHR136C	APN2	P38207	520 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YBR062C	P38239	180 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	MSR1	P38714	643 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	OCA5	P38738	679 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	SPC97	P38863	823 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	FLC2	P39719	783 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YIL054W	P40524	105 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	OPT1	P40897	799 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	TDA10	P42938	290 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YJL045W	P47052	634 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YJR054W	P47114	497 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	GCV1	P48015	400 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	BUD9	P53226	547 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YGR045C	P53229	120 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	SIW14	P53965	281 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ARO80	Q04052	950 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	CDD1	Q06549	142 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ESC8	Q08119	714 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	OPI10	Q08202	246 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	TRE1	Q08919	783 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YOR022C	Q12204	715 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	AHC1	Q12433	566 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	VPS5	Q92331	675 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	CHS1	P08004	1131 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ARG1	P22768	420 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	MKK2	P32491	506 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	SRB2	P34162	210 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ADD66	P36040	267 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	MED8	P38304	223 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YBP1	P38315	674 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	YHR202W	P38887	602 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ERP2	P39704	215 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	SAW1	P39735	261 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	SAE2	P46946	345 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ALY2	P47029	1046 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	NNF1	P47149	201 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.22	□□□□□ -1.57	not detected
SPL2	YHR136C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	CTF3	Q12748	733 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPL2	YHR136C	HAP2	P06774	265 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	PMR1	P13586	950 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	VPS3	P23643	1011 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	KDX1	P36005	433 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	HEL1	P36113	551 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	SET3	P36124	751 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	AGP2	P38090	596 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	SMF2	P38778	549 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	REV7	P38927	245 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	LYS9	P38999	446 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	ASG7	P46993	209 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	MET13	P53128	600 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	TYW3	P53177	273 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	NCE103	P53615	221 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	SHE9	Q04172	456 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	SPC24	Q04477	213 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	FMP25	Q08023	583 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	MDM38	Q08179	573 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	AVO1	Q08236	1176 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	CIR2	Q08822	631 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPL2	YHR136C	VPS54	Q12071	889 aa		5.21	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.3 ms