RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKAB2	O43741	272 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	BBOX1	O75936	387 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	MECOM	Q03112	1051 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	PHKB	Q93100	1093 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CCP110	O43303	1012 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP4C	P60510	307 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPA	Q15257	358 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	COL4A1	P02462	1669 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	SMC2	O95347	1197 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	USP5	P45974	858 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	USP17L21	D6R901	530 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SNAP23	O00161	211 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	DTNB	O60941	627 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPRE	P23469	700 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	RXRA	P19793	462 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TM4SF1	P30408	202 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNJ6	P48051	423 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	GGA1	Q9UJY5	639 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TXLNA	P40222	546 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MYL5	Q02045	173 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TROAP	Q12815	778 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	NFIX	Q14938	502 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3

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