RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Romo1P60603 79 aa9,95□□□□□ -0,82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ApcQ61315 2845 aa9,95□□□□□ -0,82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SpegQ62407 3262 aa9,94□□□□□ -0,82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm5965D3Z724 196 aa9,93□□□□□ -0,82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm10382Q3V0T5 144 aa9,93□□□□□ -0,82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP9,91□□□□□ -0,82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 VcanQ62059 3357 aa9,89□□□□□ -0,83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zzef1Q5SSH7 2924 aa9,88□□□□□ -0,83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm2310J3QNJ2 377 aa9,86□□□□□ -0,83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP9,84□□□□□ -0,83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trank1Q8BV79 2999 aa9,81□□□□□ -0,84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chd9Q8BYH8 2885 aa9,8□□□□□ -0,84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Celsr2Q9R0M0 2920 aa9,75□□□□□ -0,85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nf1Q04690 2841 aa9,74□□□□□ -0,85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rps29P62274 56 aa9,71□□□□□ -0,85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm3646F6S692 53 aa9,69□□□□□ -0,86
Ptprf-201ENSMUST00000049074 A930033H14RikG5E8X6 103 aa9,66□□□□□ -0,86
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm21887J3QQ04 176 aa9,66□□□□□ -0,86
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tenm1Q9WTS4 2731 aa9,63□□□□□ -0,87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pdzd2E9Q1M1 2796 aa9,63□□□□□ -0,87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LrbaQ9ESE1 2856 aa9,61□□□□□ -0,87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Akap9Q70FJ1 3797 aa9,59□□□□□ -0,87
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TgO08710 2766 aa9,58□□□□□ -0,88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa9,57□□□□□ -0,88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cox6b2Q80ZN9 88 aa9,56□□□□□ -0,88
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa9,51□□□□□ -0,89
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Muc5acE9QAQ8 3455 aa9,46□□□□□ -0,9
Ptprf-201ENSMUST00000049074 RelnQ60841 3461 aa9,44□□□□□ -0,9
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm9918Q8BUR5 174 aa9,43□□□□□ -0,9
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DmdP11531 3678 aa9,42□□□□□ -0,9
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vps13cQ8BX70 3748 aa9,42□□□□□ -0,9
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tenm2Q9WTS5 2764 aa9,38□□□□□ -0,91
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa9,37□□□□□ -0,91
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tnp1P10856 55 aa9,3□□□□□ -0,92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 OtogO55225 2910 aa9,25□□□□□ -0,93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm10318A0A1W2P728 225 aa9,21□□□□□ -0,93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tenm3Q9WTS6 2715 aa9,21□□□□□ -0,94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smg1Q8BKX6 3658 aaKnown RBP9,19□□□□□ -0,94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4933415A04RikQ9D443 101 aa9,14□□□□□ -0,95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 VwfQ8CIZ8 2813 aa9,11□□□□□ -0,95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Csmd1Q923L3 3564 aa9,06□□□□□ -0,96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 1700042G07RikB1AUF7 90 aa9,01□□□□□ -0,97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Megf8P60882 2789 aa9□□□□□ -0,97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP9□□□□□ -0,97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa9□□□□□ -0,97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Crct1Q6PAI5 102 aa8,98□□□□□ -0,97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prm2P07978 107 aa8,98□□□□□ -0,97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Col7a1Q63870 2944 aa8,97□□□□□ -0,97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lama5Q61001 3718 aa8,97□□□□□ -0,97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa8,94□□□□□ -0,98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa8,85□□□□□ -0,99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm20537G3UYK7 97 aa8,77□□□□□ -1,01
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SpenQ62504 3644 aaKnown RBP8,76□□□□□ -1,01
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Csmd2V9GX34 3611 aa8,71□□□□□ -1,01
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cmya5Q70KF4 3739 aa8,69□□□□□ -1,02
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa8,69□□□□□ -1,02
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa8,63□□□□□ -1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm9112A2AI92 75 aa8,62□□□□□ -1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap19-5O08632 62 aa8,56□□□□□ -1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm17416Q30KP4 66 aa8,56□□□□□ -1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa8,52□□□□□ -1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa8,48□□□□□ -1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm884A2A9H6 3643 aa8,47□□□□□ -1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Svep1A2AVA0 3567 aa8,45□□□□□ -1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP8,39□□□□□ -1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm19668J3QMD1 248 aa8,38□□□□□ -1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Muc4Q8JZM8 3443 aa8,37□□□□□ -1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SmcpP15265 143 aa8,36□□□□□ -1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ank2Q8C8R3 3898 aa8,36□□□□□ -1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Muc6Q80T03 2850 aa8,31□□□□□ -1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap13-1Q8K198 168 aa8,3□□□□□ -1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm18596A0A1W2P860 280 aa8,3□□□□□ -1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm6358A0A087WPH4 74 aa8,3□□□□□ -1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sprr2kO70562 68 aa8,24□□□□□ -1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LystP97412 3788 aa8,16□□□□□ -1,1
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm17402F6Z0L5 76 aa8,14□□□□□ -1,11
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm11939A2A592 99 aa8,11□□□□□ -1,11
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CubnQ9JLB4 3623 aa7,97□□□□□ -1,13
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap8-1O08633 61 aa7,92□□□□□ -1,14
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LorP18165 486 aa7,92□□□□□ -1,14
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm19402J3QJV4 266 aa7,91□□□□□ -1,14
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP7,88□□□□□ -1,15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Csmd3Q80T79 3707 aa7,86□□□□□ -1,15
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sprr2gO70558 76 aa7,75□□□□□ -1,17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap3-1A2A591 98 aa7,75□□□□□ -1,17
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP7,71□□□□□ -1,18
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa7,67□□□□□ -1,18
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap19-9aF8WH65 55 aa7,59□□□□□ -1,19
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa7,59□□□□□ -1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 BsnO88737 3942 aa7,55□□□□□ -1,2
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap3-2Q9D638 99 aa7,48□□□□□ -1,21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa7,48□□□□□ -1,21
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnah10D3YYQ8 4591 aa7,43□□□□□ -1,22
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lce1mQ9CR91 182 aa7,37□□□□□ -1,23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Xirp2Q4U4S6 3784 aa7,37□□□□□ -1,23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap1-5A2A590 122 aa7,35□□□□□ -1,23
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa7,33□□□□□ -1,24
Ptprf-201ENSMUST00000049074 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa7,2□□□□□ -1,26
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krtap12-1Q9Z287 130 aa7,19□□□□□ -1,26
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnah5Q8VHE6 4621 aa7,19□□□□□ -1,26
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