Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
DmdP11531 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DmdP11531 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DmdP11531 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
DmdP11531 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
DmdP11531 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DmdP11531 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DmdP11531 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
DmdP11531 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DmdP11531 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DmdP11531 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
DmdP11531 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
DmdP11531 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DmdP11531 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DmdP11531 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DmdP11531 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DmdP11531 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DmdP11531 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DmdP11531 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DmdP11531 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DmdP11531 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DmdP11531 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DmdP11531 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
DmdP11531 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DmdP11531 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DmdP11531 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DmdP11531 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DmdP11531 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
DmdP11531 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DmdP11531 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
DmdP11531 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
DmdP11531 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DmdP11531 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DmdP11531 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DmdP11531 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DmdP11531 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DmdP11531 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DmdP11531 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DmdP11531 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DmdP11531 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
DmdP11531 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DmdP11531 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DmdP11531 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
DmdP11531 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DmdP11531 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DmdP11531 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DmdP11531 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DmdP11531 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
DmdP11531 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DmdP11531 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DmdP11531 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DmdP11531 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DmdP11531 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DmdP11531 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DmdP11531 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DmdP11531 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DmdP11531 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DmdP11531 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DmdP11531 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DmdP11531 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DmdP11531 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DmdP11531 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DmdP11531 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DmdP11531 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DmdP11531 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DmdP11531 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DmdP11531 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DmdP11531 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DmdP11531 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DmdP11531 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DmdP11531 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DmdP11531 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DmdP11531 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DmdP11531 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DmdP11531 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DmdP11531 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DmdP11531 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DmdP11531 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DmdP11531 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DmdP11531 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DmdP11531 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DmdP11531 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DmdP11531 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DmdP11531 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DmdP11531 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DmdP11531 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DmdP11531 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DmdP11531 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DmdP11531 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DmdP11531 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
DmdP11531 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DmdP11531 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DmdP11531 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DmdP11531 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DmdP11531 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DmdP11531 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DmdP11531 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DmdP11531 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DmdP11531 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DmdP11531 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms