Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

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Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,07■■■■■ 4,01
DmdP11531 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
DmdP11531 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,43
DmdP11531 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,3■■■■□ 3,24
DmdP11531 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,16■■■■□ 3,06
DmdP11531 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
DmdP11531 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
DmdP11531 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,63■■■□□ 2,97
DmdP11531 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
DmdP11531 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
DmdP11531 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
DmdP11531 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
DmdP11531 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,86■■■□□ 2,85
DmdP11531 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
DmdP11531 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
DmdP11531 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
DmdP11531 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
DmdP11531 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32■■■□□ 2,71
DmdP11531 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
DmdP11531 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,91■■■□□ 2,7
DmdP11531 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
DmdP11531 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
DmdP11531 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,76■■■□□ 2,67
DmdP11531 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
DmdP11531 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,17■■■□□ 2,58
DmdP11531 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
DmdP11531 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,02■■■□□ 2,56
DmdP11531 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
DmdP11531 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
DmdP11531 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
DmdP11531 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
DmdP11531 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,66■■■□□ 2,5
DmdP11531 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
DmdP11531 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
DmdP11531 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,5■■■□□ 2,47
DmdP11531 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
DmdP11531 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
DmdP11531 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
DmdP11531 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
DmdP11531 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
DmdP11531 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,33■■■□□ 2,45
DmdP11531 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
DmdP11531 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,26■■■□□ 2,44
DmdP11531 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
DmdP11531 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,19■■■□□ 2,42
DmdP11531 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
DmdP11531 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
DmdP11531 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,01■■■□□ 2,4
DmdP11531 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
DmdP11531 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
DmdP11531 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
DmdP11531 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
DmdP11531 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
DmdP11531 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
DmdP11531 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
DmdP11531 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
DmdP11531 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
DmdP11531 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,62■■■□□ 2,33
DmdP11531 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,59■■■□□ 2,33
DmdP11531 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
DmdP11531 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
DmdP11531 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
DmdP11531 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
DmdP11531 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
DmdP11531 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
DmdP11531 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
DmdP11531 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
DmdP11531 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
DmdP11531 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
DmdP11531 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
DmdP11531 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
DmdP11531 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
DmdP11531 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
DmdP11531 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
DmdP11531 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
DmdP11531 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
DmdP11531 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
DmdP11531 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
DmdP11531 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
DmdP11531 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
DmdP11531 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
DmdP11531 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,79■■■□□ 2,2
DmdP11531 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,75■■■□□ 2,19
DmdP11531 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
DmdP11531 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
DmdP11531 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
DmdP11531 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
DmdP11531 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
DmdP11531 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
DmdP11531 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
DmdP11531 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
DmdP11531 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
DmdP11531 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
DmdP11531 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
DmdP11531 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
DmdP11531 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
DmdP11531 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
DmdP11531 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,45■■■□□ 2,14
DmdP11531 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
DmdP11531 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
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