Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19,71■□□□□ 0,75
Krtap1-4Q3V2D6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Krtap1-4Q3V2D6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Krtap1-4Q3V2D6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17,23■□□□□ 0,35
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC16,98■□□□□ 0,31
Krtap1-4Q3V2D6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16,6■□□□□ 0,25
Krtap1-4Q3V2D6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Krtap1-4Q3V2D6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16,42■□□□□ 0,22
Krtap1-4Q3V2D6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16,1■□□□□ 0,17
Krtap1-4Q3V2D6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Krtap1-4Q3V2D6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,95■□□□□ 0,14
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Krtap1-4Q3V2D6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Krtap1-4Q3V2D6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Krtap1-4Q3V2D6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15,75■□□□□ 0,11
Krtap1-4Q3V2D6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Krtap1-4Q3V2D6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Krtap1-4Q3V2D6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15,65■□□□□ 0,1
Krtap1-4Q3V2D6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15,65■□□□□ 0,1
Krtap1-4Q3V2D6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Krtap1-4Q3V2D6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,41■□□□□ 0,06
Krtap1-4Q3V2D6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15,36■□□□□ 0,05
Krtap1-4Q3V2D6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,05
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,27■□□□□ 0,04
Krtap1-4Q3V2D6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15,24■□□□□ 0,03
Krtap1-4Q3V2D6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
Krtap1-4Q3V2D6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,18■□□□□ 0,02
Krtap1-4Q3V2D6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15,15■□□□□ 0,02
Krtap1-4Q3V2D6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15,12■□□□□ 0,01
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15,09■□□□□ 0,01
Krtap1-4Q3V2D6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15,08■□□□□ 0
Krtap1-4Q3V2D6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,04■□□□□ -0
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
Krtap1-4Q3V2D6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
Krtap1-4Q3V2D6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
Krtap1-4Q3V2D6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC14,95□□□□□ -0,02
Krtap1-4Q3V2D6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC14,95□□□□□ -0,02
Krtap1-4Q3V2D6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
Krtap1-4Q3V2D6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC14,92□□□□□ -0,02
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC14,87□□□□□ -0,03
Krtap1-4Q3V2D6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,82□□□□□ -0,04
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC14,81□□□□□ -0,04
Krtap1-4Q3V2D6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC14,81□□□□□ -0,04
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Krtap1-4Q3V2D6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC14,74□□□□□ -0,05
Krtap1-4Q3V2D6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14,74□□□□□ -0,05
Krtap1-4Q3V2D6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
Krtap1-4Q3V2D6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC14,72□□□□□ -0,05
Krtap1-4Q3V2D6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14,68□□□□□ -0,06
Krtap1-4Q3V2D6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,67□□□□□ -0,06
Krtap1-4Q3V2D6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,67□□□□□ -0,06
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,64□□□□□ -0,07
Krtap1-4Q3V2D6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC14,63□□□□□ -0,07
Krtap1-4Q3V2D6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14,6□□□□□ -0,07
Krtap1-4Q3V2D6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,58□□□□□ -0,08
Krtap1-4Q3V2D6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC14,57□□□□□ -0,08
Krtap1-4Q3V2D6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC14,56□□□□□ -0,08
Krtap1-4Q3V2D6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,54□□□□□ -0,08
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC14,52□□□□□ -0,09
Krtap1-4Q3V2D6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,51□□□□□ -0,09
Krtap1-4Q3V2D6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC14,47□□□□□ -0,09
Krtap1-4Q3V2D6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC14,44□□□□□ -0,1
Krtap1-4Q3V2D6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Krtap1-4Q3V2D6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Krtap1-4Q3V2D6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC14,37□□□□□ -0,11
Krtap1-4Q3V2D6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Krtap1-4Q3V2D6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Krtap1-4Q3V2D6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC14,33□□□□□ -0,11
Krtap1-4Q3V2D6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC14,32□□□□□ -0,12
Krtap1-4Q3V2D6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
Krtap1-4Q3V2D6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC14,3□□□□□ -0,12
Krtap1-4Q3V2D6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Krtap1-4Q3V2D6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Krtap1-4Q3V2D6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC14,26□□□□□ -0,13
Krtap1-4Q3V2D6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Krtap1-4Q3V2D6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,24□□□□□ -0,13
Krtap1-4Q3V2D6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14,23□□□□□ -0,13
Krtap1-4Q3V2D6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Krtap1-4Q3V2D6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,17□□□□□ -0,14
Krtap1-4Q3V2D6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC14,15□□□□□ -0,14
Krtap1-4Q3V2D6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC14,15□□□□□ -0,14
Krtap1-4Q3V2D6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,13□□□□□ -0,15
Krtap1-4Q3V2D6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,09□□□□□ -0,15
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC14,08□□□□□ -0,16
Krtap1-4Q3V2D6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14,07□□□□□ -0,16
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC14,07□□□□□ -0,16
Krtap1-4Q3V2D6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC14,06□□□□□ -0,16
Krtap1-4Q3V2D6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,06□□□□□ -0,16
Krtap1-4Q3V2D6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,04□□□□□ -0,16
Krtap1-4Q3V2D6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,03□□□□□ -0,16
Krtap1-4Q3V2D6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC14,02□□□□□ -0,16
Krtap1-4Q3V2D6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,01□□□□□ -0,17
Krtap1-4Q3V2D6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Krtap1-4Q3V2D6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,99□□□□□ -0,17
Krtap1-4Q3V2D6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13,98□□□□□ -0,17
Krtap1-4Q3V2D6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13,97□□□□□ -0,17
Krtap1-4Q3V2D6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC13,96□□□□□ -0,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms