Protein–RNA interactions for Protein: P18165

Lor, Loricrin, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LorP18165 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LorP18165 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LorP18165 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LorP18165 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LorP18165 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LorP18165 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LorP18165 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LorP18165 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LorP18165 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LorP18165 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LorP18165 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LorP18165 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LorP18165 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LorP18165 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LorP18165 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LorP18165 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LorP18165 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LorP18165 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LorP18165 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LorP18165 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LorP18165 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LorP18165 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LorP18165 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LorP18165 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LorP18165 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LorP18165 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LorP18165 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LorP18165 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LorP18165 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LorP18165 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LorP18165 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LorP18165 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LorP18165 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LorP18165 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LorP18165 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LorP18165 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LorP18165 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LorP18165 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LorP18165 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LorP18165 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LorP18165 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LorP18165 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LorP18165 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LorP18165 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LorP18165 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LorP18165 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LorP18165 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LorP18165 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LorP18165 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LorP18165 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LorP18165 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LorP18165 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LorP18165 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LorP18165 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LorP18165 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LorP18165 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LorP18165 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LorP18165 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LorP18165 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LorP18165 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LorP18165 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LorP18165 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LorP18165 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LorP18165 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LorP18165 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LorP18165 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LorP18165 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LorP18165 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LorP18165 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LorP18165 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LorP18165 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LorP18165 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LorP18165 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LorP18165 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LorP18165 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LorP18165 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LorP18165 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LorP18165 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LorP18165 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LorP18165 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LorP18165 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LorP18165 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LorP18165 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LorP18165 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LorP18165 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LorP18165 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LorP18165 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LorP18165 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LorP18165 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LorP18165 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LorP18165 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LorP18165 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LorP18165 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LorP18165 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LorP18165 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LorP18165 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LorP18165 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LorP18165 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LorP18165 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LorP18165 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms