RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm20604F8WIA3 75 aa13,12□□□□□ -0,31
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm16253D3Z167 63 aa13,03□□□□□ -0,32
Opn3-201ENSMUST00000027809 H2al1aQ5M8Q2 105 aa13,03□□□□□ -0,32
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam229bQ8CF36 80 aa13□□□□□ -0,33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mrpl55Q9CZ83 127 aa13□□□□□ -0,33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Reg3aO09037 175 aa13□□□□□ -0,33
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prr15lQ8JZM2 100 aa12,98□□□□□ -0,33
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa12,93□□□□□ -0,34
Opn3-201ENSMUST00000027809 Serp1Q9Z1W5 66 aa12,92□□□□□ -0,34
Opn3-201ENSMUST00000027809 RetnlbQ99P86 105 aa12,89□□□□□ -0,35
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Brk1Q91VR8 75 aa12,85□□□□□ -0,35
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Defb12Q8K4N3 78 aa12,78□□□□□ -0,36
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa12,68□□□□□ -0,38
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Opn3-201ENSMUST00000027809 H2al1mQ9DAD9 105 aa12,6□□□□□ -0,39
Opn3-201ENSMUST00000027809 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa12,6□□□□□ -0,39
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Opn3-201ENSMUST00000027809 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa12,53□□□□□ -0,4
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fat3Q8BNA6 4555 aa12,51□□□□□ -0,41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa12,49□□□□□ -0,41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Spint4Q9D263 159 aa12,49□□□□□ -0,41
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Defb13Q8R2I4 64 aa12,41□□□□□ -0,42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm10267M0QWD8 85 aa12,4□□□□□ -0,42
Opn3-201ENSMUST00000027809 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa12,38□□□□□ -0,43
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm10197F6QEY5 67 aa12,32□□□□□ -0,44
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Chtf8P0CG14 533 aa12,21□□□□□ -0,45
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa12,04□□□□□ -0,48
Opn3-201ENSMUST00000027809 Defb38Q7TNV7 63 aa12,03□□□□□ -0,48
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm5965D3Z724 196 aa11,97□□□□□ -0,49
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Ndufb1P0DN34 57 aa11,74□□□□□ -0,53
Opn3-201ENSMUST00000027809 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa11,74□□□□□ -0,53
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Herc1E9PZP8 4859 aa11,59□□□□□ -0,55
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rnase13Q5GAM7 153 aa11,58□□□□□ -0,55
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lrp2A2ARV4 4660 aa11,58□□□□□ -0,56
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Uqcr11Q9CPX8 56 aa11,54□□□□□ -0,56
Opn3-201ENSMUST00000027809 9230102O04RikA2ASX7 82 aa11,53□□□□□ -0,56
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm3646F6S692 53 aa11,5□□□□□ -0,57
Opn3-201ENSMUST00000027809 1700042G07RikB1AUF7 90 aa11,47□□□□□ -0,57
Opn3-201ENSMUST00000027809 Defb1P56386 69 aa11,43□□□□□ -0,58
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP11,27□□□□□ -0,6
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