RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm11627A6PWP4 55 aa8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ndufb1P0DN34 57 aa8.83□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 P01819 144 aa8.83□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Spata3Q9D9T6 193 aa8.83□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 SnurfQ9WU12 71 aa8.83□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 KalrnA2CG49 2964 aa8.82□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pou2af1Q64693 256 aa8.82□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sox16Q62247 57 aa8.82□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa8.82□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mrpl34Q99N91 92 aa8.81□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Vps13aQ5H8C4 3166 aa8.81□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chd6A3KFM7 2711 aa8.8□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dmac1Q9CQ00 111 aa8.8□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 9230102O04RikA2ASX7 82 aa8.79□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm21886J3QJU9 214 aa8.79□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10837Q3UTT8 145 aa8.79□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lypd5Q9D7Z7 256 aa8.79□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Igkv8-27A0A0G2JF28 120 aa8.78□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 2310034G01RikA0A286YDL3 209 aa8.78□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Csdc2Q91YQ3 154 aa8.78□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lelp1Q9DAE3 120 aa8.78□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AI854703Q8BIN3 203 aa8.78□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cdh23Q99PF4 3354 aa8.78□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa8.78□□□□□ -1
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Elof1P60003 83 aa8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Serp1Q9Z1W5 66 aa8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ranbp2Q9ERU9 3053 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Znf414Q9DCK4 299 aa8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 HrnrQ8VHD8 2496 aa8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10570F6VB42 170 aa8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AI606181Q8C7B9 129 aa8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm9903Q8C9Y8 129 aa8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 H2al1mQ9DAD9 105 aa8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fam19a3Q7TPG6 132 aa8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Kmt2bO08550 2713 aa8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Igkv8-19A0A0G2JFN8 121 aa8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Coa6Q8BGD8 79 aa8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chchd10Q7TNL9 138 aa8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Psors1c2Q80ZC9 134 aa8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AspmQ8CJ27 3122 aa8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ighv2-5A0A0A6YY69 116 aa8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10770F7D043 238 aa8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dmbt1Q60997 2085 aa8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eif4ebp3Q80VV3 101 aa8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fam168bQ80XQ8 194 aa8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AplnQ9R0R4 77 aa8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Itpr3P70227 2670 aa8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm5617Q91VN2 117 aa8.67□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa8.67□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Prol1E9PYQ4 312 aa8.67□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Spaca4Q80ZQ0 127 aa8.67□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sprr4Q8CGN8 76 aa8.67□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 H2al1kJ3QP08 105 aa8.66□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 1810062G17RikG3X8Y2 129 aa8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Igsf10Q3V1M1 2594 aa8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Defb50Q6TU36 73 aa8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 P01821 116 aa8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Bean1Q9EQG5 255 aa8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10337F7DEP7 55 aa8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Q8BT88 171 aa8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 RetnlbQ99P86 105 aa8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10160F6Y577 67 aa8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rpl37aP61514 92 aa8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10197F6QEY5 67 aa8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm17689B3GLJ4 109 aa8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AY074887Q8R5F9 132 aa8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm7138L7N2C3 230 aa8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm3238W4VSP7 230 aa8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Muc2Q80Z19 2680 aa8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm7137J3QMW1 236 aa8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm27235Q3UW50 83 aa8.59□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10999F6Q4M4 69 aa8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tep1P97499 2629 aa8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa8.57□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Krtap16-1A2A5X5 502 aa8.56□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Col6a5A6H584 2640 aa8.56□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pkd1l1Q8R526 2615 aa8.56□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sprr1bQ62267 153 aa8.56□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 C530025M09RikF6RGA8 229 aa8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm10308Q9CVR5 141 aa8.55□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Szt2A2A9C3 3431 aa8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa8.54□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Frem2Q6NVD0 3160 aa8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plac8Q9JI48 112 aa8.53□□□□□ -1.04
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Spint4Q9D263 159 aa8.52□□□□□ -1.05
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Celsr1O35161 3034 aa8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Unc80Q8BLN6 3261 aa8.51□□□□□ -1.05
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm17606F6ZL36 78 aa8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 BptfA2A654 3036 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 99.1 ms