RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa12,84□□□□□ -0,35
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ufsp1Q9CZP0 217 aa12,84□□□□□ -0,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa12,84□□□□□ -0,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sec11aQ9R0P6 179 aa12,84□□□□□ -0,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa12,83□□□□□ -0,36
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Phpt1Q9DAK9 124 aa12,83□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa12,83□□□□□ -0,36
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wfdc6bF6ULY1 148 aa12,82□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ube2bP63147 152 aa12,82□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa12,8□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa12,8□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CrxO54751 299 aa12,8□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pglyrp4Q0VB07 374 aa12,8□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Q3UNZ8 350 aa12,8□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plpp2Q9DAX2 276 aa12,8□□□□□ -0,36
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MifP34884 115 aaKnown RBP12,79□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tmem136Q3TYE7 245 aa12,79□□□□□ -0,36
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Timm17aQ9Z0V8 171 aa12,79□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fndc10A2A9Q0 223 aa12,78□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Obox2E9PXV9 151 aa12,78□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mrpl32Q9DCI9 187 aaKnown RBP12,78□□□□□ -0,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bsph2Q0Q236 131 aa12,77□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm10549Q3URY4 149 aa12,77□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa12,76□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Defa13P50711 93 aa12,76□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ceacam12Q3UKP4 300 aa12,76□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa12,75□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm10642Q3TWM1 71 aa12,75□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam19a3Q7TPG6 132 aa12,75□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 HrnrQ8VHD8 2496 aa12,74□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ndufa5Q9CPP6 116 aa12,74□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 C530025M09RikF6RGA8 229 aa12,73□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Hbb-b2P02089 147 aa12,73□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Commd5Q8R395 224 aa12,73□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sec11cQ9D8V7 192 aa12,72□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 ManbalQ9D8X0 85 aa12,72□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm10842Q3U587 122 aa12,71□□□□□ -0,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 GhrhP16043 103 aa12,7□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mrpl18Q9CQL5 180 aa12,7□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wfdc12Q9JHY3 85 aa12,7□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trav8-1A0A075B641 109 aa12,69□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Prol1E9PYQ4 312 aa12,69□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TbpP29037 316 aa12,69□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tspo2Q9CRZ8 162 aa12,68□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ankrd39Q9D2X0 183 aa12,68□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa12,67□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa12,67□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bloc1s1O55102 125 aa12,67□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 BC106179Q8C9L1 186 aa12,67□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa12,66□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa12,66□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa12,65□□□□□ -0,38
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Defb12Q8K4N3 78 aa12,65□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Carhsp1Q9CR86 148 aa12,65□□□□□ -0,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zfp930A0A1D5RM15 441 aa12,64□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP12,64□□□□□ -0,39
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 OtorQ9JIE3 128 aa12,64□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa12,62□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm1553Q66VB7 94 aa12,62□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 RhebQ921J2 184 aa12,61□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Josd1Q9DBJ6 202 aa12,61□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc179J3QM76 67 aa12,6□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tmem170bP86050 132 aa12,6□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wfdc10Q3V2J9 124 aa12,6□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm20726G3UX18 150 aa12,59□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 P01755 137 aa12,59□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rab5bP61021 215 aa12,59□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa12,59□□□□□ -0,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa12,58□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fabp4P04117 132 aa12,58□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Defb50Q6TU36 73 aa12,58□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm10130F6ZHM5 101 aa12,57□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Defa4P28311 92 aa12,57□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Smim7Q5RKS2 75 aa12,57□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Defb39Q70KL3 74 aa12,57□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Leprotl1Q9CQ74 131 aa12,56□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Scgb2a2J3KMP9 96 aa12,55□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trav13-2A0A075B649 110 aa12,54□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Q9CRC3 126 aa12,54□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fgf23Q9EPC2 251 aa12,54□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 P84750 121 aa12,53□□□□□ -0,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gng4P50153 75 aa12,52□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam19a2Q7TPG7 131 aa12,52□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mpv17l2Q8VIK2 200 aa12,52□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bean1Q9EQG5 255 aa12,52□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Hspb8Q9JK92 196 aa12,52□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa12,51□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 SpxD3Z752 116 aa12,51□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Krtap17-1A2A5X6 109 aa12,5□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Defa20Q45VN2 95 aa12,5□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lgals4Q8K419 326 aa12,5□□□□□ -0,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Scgb1b29D2XZ31 93 aa12,49□□□□□ -0,41
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