Protein–RNA interactions for Protein: Q8R395

Commd5, COMM domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd5Q8R395 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Commd5Q8R395 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Commd5Q8R395 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Commd5Q8R395 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Commd5Q8R395 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Commd5Q8R395 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Commd5Q8R395 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Commd5Q8R395 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Commd5Q8R395 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Commd5Q8R395 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Commd5Q8R395 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1,59
Commd5Q8R395 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Commd5Q8R395 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Commd5Q8R395 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Commd5Q8R395 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Commd5Q8R395 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Commd5Q8R395 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Commd5Q8R395 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Commd5Q8R395 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Commd5Q8R395 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Commd5Q8R395 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Commd5Q8R395 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Commd5Q8R395 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
Commd5Q8R395 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Commd5Q8R395 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Commd5Q8R395 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Commd5Q8R395 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Commd5Q8R395 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Commd5Q8R395 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Commd5Q8R395 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Commd5Q8R395 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Commd5Q8R395 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Commd5Q8R395 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
Commd5Q8R395 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Commd5Q8R395 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Commd5Q8R395 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Commd5Q8R395 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Commd5Q8R395 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Commd5Q8R395 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Commd5Q8R395 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Commd5Q8R395 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Commd5Q8R395 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Commd5Q8R395 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Commd5Q8R395 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Commd5Q8R395 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Commd5Q8R395 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Commd5Q8R395 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Commd5Q8R395 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Commd5Q8R395 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Commd5Q8R395 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Commd5Q8R395 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Commd5Q8R395 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Commd5Q8R395 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Commd5Q8R395 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,24
Commd5Q8R395 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Commd5Q8R395 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Commd5Q8R395 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Commd5Q8R395 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Commd5Q8R395 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Commd5Q8R395 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Commd5Q8R395 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Commd5Q8R395 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Commd5Q8R395 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Commd5Q8R395 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Commd5Q8R395 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Commd5Q8R395 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Commd5Q8R395 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
Commd5Q8R395 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Commd5Q8R395 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Commd5Q8R395 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Commd5Q8R395 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Commd5Q8R395 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,46■■□□□ 1,19
Commd5Q8R395 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Commd5Q8R395 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Commd5Q8R395 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Commd5Q8R395 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Commd5Q8R395 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Commd5Q8R395 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Commd5Q8R395 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,34■■□□□ 1,17
Commd5Q8R395 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Commd5Q8R395 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Commd5Q8R395 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Commd5Q8R395 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Commd5Q8R395 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Commd5Q8R395 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Commd5Q8R395 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,22■■□□□ 1,15
Commd5Q8R395 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Commd5Q8R395 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Commd5Q8R395 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Commd5Q8R395 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Commd5Q8R395 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Commd5Q8R395 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Commd5Q8R395 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Commd5Q8R395 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Commd5Q8R395 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Commd5Q8R395 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Commd5Q8R395 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
Commd5Q8R395 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Commd5Q8R395 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Commd5Q8R395 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
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