Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab5bP61021 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab5bP61021 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab5bP61021 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab5bP61021 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab5bP61021 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab5bP61021 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab5bP61021 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab5bP61021 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab5bP61021 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab5bP61021 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab5bP61021 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab5bP61021 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab5bP61021 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab5bP61021 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab5bP61021 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab5bP61021 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab5bP61021 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab5bP61021 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab5bP61021 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab5bP61021 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab5bP61021 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rab5bP61021 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab5bP61021 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab5bP61021 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab5bP61021 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab5bP61021 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab5bP61021 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab5bP61021 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab5bP61021 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab5bP61021 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab5bP61021 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab5bP61021 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab5bP61021 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab5bP61021 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab5bP61021 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab5bP61021 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab5bP61021 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab5bP61021 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab5bP61021 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab5bP61021 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab5bP61021 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab5bP61021 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab5bP61021 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab5bP61021 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab5bP61021 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab5bP61021 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab5bP61021 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab5bP61021 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab5bP61021 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab5bP61021 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab5bP61021 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab5bP61021 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab5bP61021 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab5bP61021 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab5bP61021 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab5bP61021 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab5bP61021 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab5bP61021 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab5bP61021 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab5bP61021 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab5bP61021 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab5bP61021 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab5bP61021 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab5bP61021 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab5bP61021 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab5bP61021 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab5bP61021 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab5bP61021 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab5bP61021 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab5bP61021 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab5bP61021 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab5bP61021 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab5bP61021 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab5bP61021 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab5bP61021 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab5bP61021 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab5bP61021 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab5bP61021 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab5bP61021 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab5bP61021 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab5bP61021 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab5bP61021 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab5bP61021 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab5bP61021 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab5bP61021 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab5bP61021 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab5bP61021 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rab5bP61021 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab5bP61021 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab5bP61021 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab5bP61021 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms