Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
TbpP29037 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
TbpP29037 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
TbpP29037 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
TbpP29037 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
TbpP29037 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
TbpP29037 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
TbpP29037 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
TbpP29037 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
TbpP29037 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
TbpP29037 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
TbpP29037 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
TbpP29037 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
TbpP29037 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
TbpP29037 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
TbpP29037 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
TbpP29037 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
TbpP29037 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,46■■□□□ 1,19
TbpP29037 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
TbpP29037 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
TbpP29037 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
TbpP29037 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
TbpP29037 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
TbpP29037 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
TbpP29037 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
TbpP29037 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
TbpP29037 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
TbpP29037 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
TbpP29037 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
TbpP29037 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
TbpP29037 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
TbpP29037 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
TbpP29037 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
TbpP29037 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
TbpP29037 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,51■■□□□ 1,03
TbpP29037 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
TbpP29037 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
TbpP29037 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
TbpP29037 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
TbpP29037 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,42■■□□□ 1,02
TbpP29037 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
TbpP29037 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
TbpP29037 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
TbpP29037 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
TbpP29037 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,32■■□□□ 1
TbpP29037 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
TbpP29037 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
TbpP29037 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
TbpP29037 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
TbpP29037 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
TbpP29037 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
TbpP29037 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
TbpP29037 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
TbpP29037 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
TbpP29037 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
TbpP29037 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
TbpP29037 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,92■□□□□ 0,94
TbpP29037 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
TbpP29037 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
TbpP29037 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
TbpP29037 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
TbpP29037 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
TbpP29037 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
TbpP29037 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
TbpP29037 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
TbpP29037 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
TbpP29037 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
TbpP29037 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
TbpP29037 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
TbpP29037 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,72■□□□□ 0,91
TbpP29037 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
TbpP29037 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
TbpP29037 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
TbpP29037 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
TbpP29037 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,67■□□□□ 0,9
TbpP29037 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
TbpP29037 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
TbpP29037 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
TbpP29037 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
TbpP29037 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
TbpP29037 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
TbpP29037 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
TbpP29037 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
TbpP29037 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
TbpP29037 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
TbpP29037 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
TbpP29037 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
TbpP29037 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
TbpP29037 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
TbpP29037 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,84
TbpP29037 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
TbpP29037 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
TbpP29037 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
TbpP29037 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
TbpP29037 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
TbpP29037 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
TbpP29037 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,26■□□□□ 0,83
TbpP29037 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
TbpP29037 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
TbpP29037 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
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