Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TbpP29037 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TbpP29037 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TbpP29037 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbpP29037 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TbpP29037 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TbpP29037 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TbpP29037 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TbpP29037 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbpP29037 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TbpP29037 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TbpP29037 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TbpP29037 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TbpP29037 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbpP29037 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbpP29037 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TbpP29037 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TbpP29037 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbpP29037 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbpP29037 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TbpP29037 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbpP29037 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbpP29037 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbpP29037 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbpP29037 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TbpP29037 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbpP29037 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbpP29037 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TbpP29037 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TbpP29037 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TbpP29037 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TbpP29037 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbpP29037 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TbpP29037 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbpP29037 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TbpP29037 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TbpP29037 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TbpP29037 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TbpP29037 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TbpP29037 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TbpP29037 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbpP29037 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbpP29037 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TbpP29037 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TbpP29037 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TbpP29037 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TbpP29037 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbpP29037 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TbpP29037 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TbpP29037 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TbpP29037 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TbpP29037 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TbpP29037 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TbpP29037 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TbpP29037 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TbpP29037 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbpP29037 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TbpP29037 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TbpP29037 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TbpP29037 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TbpP29037 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TbpP29037 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TbpP29037 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TbpP29037 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TbpP29037 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TbpP29037 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TbpP29037 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TbpP29037 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TbpP29037 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TbpP29037 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TbpP29037 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TbpP29037 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TbpP29037 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TbpP29037 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TbpP29037 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TbpP29037 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TbpP29037 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbpP29037 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TbpP29037 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TbpP29037 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TbpP29037 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TbpP29037 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TbpP29037 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TbpP29037 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TbpP29037 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TbpP29037 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TbpP29037 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TbpP29037 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TbpP29037 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TbpP29037 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TbpP29037 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TbpP29037 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TbpP29037 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TbpP29037 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TbpP29037 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TbpP29037 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TbpP29037 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TbpP29037 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TbpP29037 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TbpP29037 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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