RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Znf740Q6NZQ6 180 aa6.67□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mpv17l2Q8VIK2 200 aa6.67□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ighv1-72P01751 139 aa6.66□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ube2d1P61080 147 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa6.66□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pgpep1Q9ESW8 209 aa6.66□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dpm2Q9Z324 84 aa6.66□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa6.66□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm28044L7N1X0 119 aa6.66□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mzt1Q8BUR9 78 aa6.66□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Akap13E9Q394 2776 aa6.65□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defa3P28310 93 aa6.65□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defa10P50708 93 aa6.65□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defa15P50713 93 aa6.65□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Foxi2Q3I5G5 311 aa6.65□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm9747Q810H1 104 aa6.65□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ankrd39Q9D2X0 183 aa6.65□□□□□ -1.34
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm3233E9Q2H5 230 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gpha2Q925Q5 128 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trav9d-3A0A075B695 113 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 NrepQ07475 68 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dmrt3Q80WT2 476 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prelid3aQ8VE85 172 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tac4Q99N14 128 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Klk5Q9D140 293 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Klk11Q9QYN3 276 aa6.64□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppp1r32Q148A4 427 aa6.63□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gatd1Q8BFQ8 220 aa6.63□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ifitm10Q8BR26 201 aa6.63□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 E130114P18RikF6S0S7 154 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Spink4O35679 86 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cfap126Q6P8X9 189 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Il1f10Q8R459 152 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gemin7Q9CWY4 129 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ly6gP35461 111 aa6.62□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tenm4Q3UHK6 2771 aa6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ighv1-59A0A0A6YXE0 117 aa6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krtap16-1A2A5X5 502 aa6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Esp24A8R0V6 68 aa6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm6812B1AXU1 112 aa6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm42674D3YUT9 64 aa6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 CrygaP04345 174 aa6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Foxc1Q61572 553 aa6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm28539A0A087WSL9 92 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 PolP10400 120 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 P01745 121 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cox7a1P56392 80 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dad1P61804 113 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 SrarpQ3ULG3 163 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Psors1c2Q80ZC9 134 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Leap2Q91V13 76 aa6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 1700020N15RikL7MTX3 112 aa6.59□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 P01729 129 aa6.59□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Spink1P09036 80 aa6.59□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Xlr5cQ9JJR2 179 aa6.59□□□□□ -1.35
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa6.58□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Atp5g3P56384 141 aa6.58□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Plac8l1Q08EJ0 177 aa6.58□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 BB014433Q8C5R5 389 aa6.58□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Atp5g1Q9CR84 136 aa6.58□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Spry2Q9QXV8 315 aa6.58□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv4-54A0A0G2JES9 117 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv4-61A0A0G2JH00 117 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm6793B2RXM2 351 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm7257D3YX25 99 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Atp5eP56382 52 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv4-79A0A075B5L8 119 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10772F7AIG4 85 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 CirbpP60824 172 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10735Q3US96 136 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vmo1Q5SXG7 201 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dand5Q76LW6 185 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lgals4Q8K419 326 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 9430069I07RikQ9CX21 111 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Triap1Q9D8Z2 76 aa6.57□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igfn1Q3KNY0 2849 aa6.56□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa6.56□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 NpwA0A1L1STR8 176 aa6.56□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm9513B3GLJ6 99 aa6.56□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm933J3QPC1 141 aa6.56□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mfap4Q9D1H9 257 aa6.56□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dmbt1Q60997 2085 aa6.56□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Itpr2Q9Z329 2701 aa6.55□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lect2O88803 151 aa6.55□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 P01811 117 aa6.55□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 PrcdQ00LT2 53 aa6.55□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm904Q3V2L5 102 aa6.55□□□□□ -1.36
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ss18l2Q9D174 77 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.3 ms