RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ucn2Q99ML8 113 aa9.11□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Runx1Q03347 451 aa9.1□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv3-5A0A140T8M6 119 aa9.1□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Alms1Q8K4E0 3251 aa9.1□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav13d-1A0A075B606 110 aa9.1□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dennd4cA6H8H2 1906 aa9.1□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 DscamQ9ERC8 2013 aa9.1□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm14137Q8CE97 175 aa9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Iglv1A0A075B663 117 aa9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Plscr4P58196 326 aa9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gphb5Q812B2 130 aa9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Crip1P63254 77 aa9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 B9d2Q3UK10 175 aa9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Camk2n2Q78WH7 79 aa9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 Odf3l1Q810P2 275 aa9.09□□□□□ -0.95
Ctif-201ENSMUST00000165559 IgipA0A1B0GR74 53 aa9.09□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav3-4A0A075B654 114 aa9.08□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trbv16A0A0B4J1H3 115 aa9.08□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv8-18A0A0B4J1J3 123 aa9.08□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Egr2P08152 470 aa9.08□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defa27F2Z403 93 aa9.08□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm10518F6UQQ9 182 aa9.08□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rpl39P62892 51 aa9.08□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa9.08□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Usf3B2RUQ2 2221 aa9.07□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Vsig4F6TUL9 280 aa9.07□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lst1O08843 95 aa9.07□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccl25O35903 144 aa9.07□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav4d-3A0A075B625 110 aa9.06□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Klk5Q9D140 293 aa9.06□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ube2aQ9Z255 152 aa9.06□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Obox8V9GWY9 217 aa9.06□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa9.06□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Timm17aQ9Z0V8 171 aa9.06□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm9573F7C950 1606 aa9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pet100P0DJE0 76 aa9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Foxi2Q3I5G5 311 aa9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm9936Q8C864 160 aa9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm17472A0A075B683 117 aa9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tet1Q3URK3 2007 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 MifP34884 115 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cd33Q63994 403 aa9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fam19a4Q7TPG5 135 aa9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 FancmQ8BGE5 2021 aa9.05□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav9n-4A0A075B631 113 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav13-4-dv7A0A075B6C2 110 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mlst8Q9DCJ1 326 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sh2d1aO88890 126 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 P84751 237 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 OtoglF7A4A7 2325 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fxyd5P97808 178 aa9.04□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Notch3Q61982 2318 aa9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Glrp1E9Q9S8 174 aa9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 7420426K07RikQ3UX66 186 aa9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav13-2A0A075B649 110 aa9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm17577J3QNF7 156 aa9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dido1Q8C9B9 2256 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 HelzQ6DFV5 1964 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Q9CX25 107 aa9.03□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Prr12E9PYL2 2035 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01747 120 aa9.02□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 PscaP57096 123 aa9.02□□□□□ -0.96
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defb47Q30KN1 79 aa9.02□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Clec4b2Q67DU8 208 aa9.02□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fam240bJ3QMB3 78 aa9.02□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa9.02□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mrpl35Q9CQL6 188 aa9.02□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Oxld1Q9CR10 201 aa9.02□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ociad2Q9D8W7 154 aa9.02□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 P06328 117 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Myo9aQ8C170 2542 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 CrygfQ9CXV3 174 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tcte2E9PY37 120 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 9430069I07RikQ9CX21 111 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv3-10A0A0G2JGN0 119 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 PtprsB0V2N1 1907 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ptpn13Q64512 2453 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Odf3Q920N1 254 aa9.01□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ankhd1E9PUR0 2548 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Heatr5aQ5PRF0 2038 aa9□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cox7cP17665 63 aa9□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm10542F6XDR3 90 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01658 132 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pcp4P63054 62 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Edn2P22389 175 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 AW146154Q3TPQ7 468 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav13-1A0A075B644 110 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm21060J3KMU4 56 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctif-201ENSMUST00000165559 Wfdc2Q9DAU7 174 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms