Protein–RNA interactions for Protein: P22389

Edn2, Endothelin-2, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn2P22389 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Edn2P22389 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Edn2P22389 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Edn2P22389 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Edn2P22389 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Edn2P22389 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Edn2P22389 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Edn2P22389 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Edn2P22389 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Edn2P22389 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Edn2P22389 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Edn2P22389 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Edn2P22389 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Edn2P22389 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Edn2P22389 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Edn2P22389 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Edn2P22389 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Edn2P22389 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Edn2P22389 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Edn2P22389 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Edn2P22389 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Edn2P22389 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Edn2P22389 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Edn2P22389 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Edn2P22389 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Edn2P22389 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Edn2P22389 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Edn2P22389 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Edn2P22389 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Edn2P22389 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
Edn2P22389 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Edn2P22389 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Edn2P22389 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Edn2P22389 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Edn2P22389 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Edn2P22389 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Edn2P22389 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Edn2P22389 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Edn2P22389 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Edn2P22389 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Edn2P22389 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Edn2P22389 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Edn2P22389 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Edn2P22389 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Edn2P22389 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Edn2P22389 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Edn2P22389 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Edn2P22389 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Edn2P22389 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Edn2P22389 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Edn2P22389 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Edn2P22389 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Edn2P22389 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Edn2P22389 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Edn2P22389 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Edn2P22389 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Edn2P22389 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Edn2P22389 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Edn2P22389 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Edn2P22389 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Edn2P22389 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Edn2P22389 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
Edn2P22389 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Edn2P22389 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,23
Edn2P22389 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Edn2P22389 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Edn2P22389 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Edn2P22389 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Edn2P22389 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Edn2P22389 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Edn2P22389 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,7■■□□□ 1,22
Edn2P22389 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Edn2P22389 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Edn2P22389 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Edn2P22389 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Edn2P22389 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Edn2P22389 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Edn2P22389 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Edn2P22389 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Edn2P22389 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Edn2P22389 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Edn2P22389 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Edn2P22389 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Edn2P22389 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
Edn2P22389 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,47■■□□□ 1,19
Edn2P22389 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Edn2P22389 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Edn2P22389 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Edn2P22389 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Edn2P22389 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Edn2P22389 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Edn2P22389 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Edn2P22389 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Edn2P22389 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Edn2P22389 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Edn2P22389 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Edn2P22389 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,23■■□□□ 1,15
Edn2P22389 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Edn2P22389 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Edn2P22389 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms