Protein–RNA interactions for Protein: P22389

Edn2, Endothelin-2, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn2P22389 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Edn2P22389 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Edn2P22389 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edn2P22389 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Edn2P22389 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Edn2P22389 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Edn2P22389 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Edn2P22389 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Edn2P22389 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edn2P22389 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edn2P22389 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edn2P22389 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Edn2P22389 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Edn2P22389 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edn2P22389 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Edn2P22389 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edn2P22389 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Edn2P22389 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edn2P22389 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edn2P22389 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Edn2P22389 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edn2P22389 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Edn2P22389 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edn2P22389 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edn2P22389 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edn2P22389 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edn2P22389 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edn2P22389 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edn2P22389 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edn2P22389 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Edn2P22389 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edn2P22389 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edn2P22389 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Edn2P22389 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edn2P22389 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Edn2P22389 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edn2P22389 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Edn2P22389 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edn2P22389 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edn2P22389 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edn2P22389 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edn2P22389 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edn2P22389 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edn2P22389 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edn2P22389 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edn2P22389 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edn2P22389 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Edn2P22389 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edn2P22389 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Edn2P22389 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edn2P22389 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Edn2P22389 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Edn2P22389 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Edn2P22389 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Edn2P22389 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Edn2P22389 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Edn2P22389 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Edn2P22389 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Edn2P22389 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Edn2P22389 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Edn2P22389 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Edn2P22389 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Edn2P22389 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Edn2P22389 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Edn2P22389 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edn2P22389 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Edn2P22389 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edn2P22389 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edn2P22389 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edn2P22389 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edn2P22389 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Edn2P22389 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edn2P22389 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edn2P22389 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Edn2P22389 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Edn2P22389 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edn2P22389 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edn2P22389 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edn2P22389 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edn2P22389 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edn2P22389 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edn2P22389 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edn2P22389 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edn2P22389 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Edn2P22389 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Edn2P22389 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edn2P22389 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edn2P22389 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edn2P22389 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Edn2P22389 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edn2P22389 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edn2P22389 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edn2P22389 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edn2P22389 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Edn2P22389 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edn2P22389 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edn2P22389 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Edn2P22389 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edn2P22389 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edn2P22389 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms