RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-53A0A075B5W3 117 aa9.07□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cox7a1P56392 80 aa9.07□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10604Q3V0X7 143 aa9.07□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa9.07□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ndufc2Q9CQ54 120 aa9.07□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 LhbO09108 141 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vamp8O70404 101 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 NpsP0C0P8 89 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam222aQ6PGH4 453 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Prelid3aQ8VE85 172 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Spink12Q9D256 87 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rmi2Q3UPE3 149 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Smg1Q8BKX6 3658 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 7420426K07RikQ3UX66 186 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dnal4Q9DCM4 105 aa9.06□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 BC107364E9Q5A2 140 aa9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PrlhG3UWC3 86 aa9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 A130051J06RikQ8CAU1 227 aa9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sh2d1aO88890 126 aa9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Runx1Q03347 451 aa9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stab1Q8R4Y4 2571 aa9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm20499D3Z4G5 72 aa9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 TshbP12656 138 aa9.05□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chd9Q8BYH8 2885 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Wfdc2Q9DAU7 174 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm5878E9PUB3 99 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vmo1Q5SXG7 201 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm28269A0A087WSG3 125 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10226O88253 85 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf740Q6NZQ6 180 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ebi3O35228 228 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Foxi2Q3I5G5 311 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SNORCQ9CXL7 121 aa9.04□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa9.03□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cend1Q9JKC6 149 aa9.03□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Insl3O09107 122 aa9.03□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tdgf1P51865 171 aa9.03□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Hbb-bsA8DUK4 147 aa9.03□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Hbb-b1P02088 147 aa9.03□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P18527 97 aa9.03□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rnf185Q91YT2 192 aa9.02□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Phpt1Q9DAK9 124 aa9.02□□□□□ -0.96
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm45213A0A0U1RNZ6 101 aa9.02□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mtatp8P03930 67 aa9.02□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q8R092 253 aa9.02□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Klk5Q9D140 293 aa9.02□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 1500011B03RikQ3TTH7 73 aa9.02□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Shisa9Q9CZN4 424 aa9.02□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam216aQ9DB54 251 aa9.02□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa9.02□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ang3P97802 145 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Odf1Q61999 247 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vsig4F6TUL9 280 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Crlf1Q9JM58 425 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Clec5aQ9R007 190 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10542F6XDR3 90 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dmrt3Q80WT2 476 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chchd5Q9CQP3 110 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lelp1Q9DAE3 120 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igfn1Q3KNY0 2849 aa9.01□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa9□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cd69P37217 199 aa9□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cfap126Q6P8X9 189 aa9□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa9□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa9□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa9□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa9□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 1700056E22RikF7CNM6 234 aa8.99□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tep1P97499 2629 aa8.99□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mrpl35Q9CQL6 188 aa8.99□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa8.98□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pxt1Q8K459 51 aa8.98□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem238A9JSM3 176 aa8.98□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dad1P61804 113 aa8.98□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam241bQ9D882 120 aa8.98□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Snai3Q9QY31 287 aa8.98□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chd6A3KFM7 2711 aa8.98□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 D130052B06RikQ3UW13 202 aa8.98□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fhl2O70433 279 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lyzl4Q9D925 145 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Defb47Q30KN1 79 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Prr9Q8BV84 116 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mpv17l2Q8VIK2 200 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cox6cQ9CPQ1 76 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SbsponQ3UPR9 264 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cks1bP61025 79 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tac4Q99N14 128 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dpm2Q9Z324 84 aa8.97□□□□□ -0.97
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 1700020N15RikL7MTX3 112 aa8.96□□□□□ -0.98
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Defa1P11477 93 aa8.96□□□□□ -0.98
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv13-2A0A0A6YWN3 119 aa8.96□□□□□ -0.98
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 BtcQ05928 177 aa8.95□□□□□ -0.98
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 5730522E02RikQ5SP45 163 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.4 ms