RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nbl1Q61477 178 aa12□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Scn10aQ6QIY3 1958 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 ThadaA8C756 1938 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Myo7bQ99MZ6 2113 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm5129F6YHA9 99 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mbd6Q3TY92 1003 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Spink4O35679 86 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Atp5g3P56384 141 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmem14cQ9CQN6 114 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Atp5g1Q9CR84 136 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rp1P56716 2095 aa11.99□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 P01756 117 aa11.98□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 P01757 117 aa11.98□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Acyp1P56376 99 aa11.98□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 B9d2Q3UK10 175 aa11.98□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Bex1Q9R224 128 aa11.98□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Zfp36l1P23950 338 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Igkv12-89A0A0G2JGW8 112 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 P01750 117 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slc25a29Q8BL03 306 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 9530003J23RikQ8BM26 151 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Q08AU9 97 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Igkv3-4A0A140T8Q4 119 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm10735Q3US96 136 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tomm6Q9CQN3 74 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa11.97□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa11.96□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ang4Q3TMQ6 144 aa11.96□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa11.96□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 CrygdP04342 174 aa11.96□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ptprz1B9EKR1 2312 aa11.96□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PemtQ61907 199 aa11.96□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Camk2n2Q78WH7 79 aa11.96□□□□□ -0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Frem1Q684R7 2191 aa11.96□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa11.96□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pom121l2Q5SW25 972 aa11.96□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rbmy1bQ60990 380 aa11.96□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nckap5E9QAE1 1909 aa11.96□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trip12G5E870 2025 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Klhdc3Q8VEM9 382 aa11.96□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Them7Q9DCP4 223 aa11.96□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ntf4Q80VU4 209 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 9930022D16RikQ8BG27 128 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Vopp1Q8R1C3 172 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 StrcQ8VIM6 1809 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sh2d1aO88890 126 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 BB014433Q8C5R5 389 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Znf672Q99LH4 468 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pcnx1Q9QYC1 2344 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Klk12B2RVZ0 247 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 P01753 117 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PscaP57096 123 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tal2Q62282 108 aa11.95□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmem243B2RVB9 118 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pglyrp1O88593 182 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Col8a2P25318 699 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trav13-1A0A075B644 110 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trav13-4-dv7A0A075B6C2 110 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Col6a4A2AX52 2309 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Plscr4P58196 326 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cox7b2Q9D2H1 82 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trav13d-1A0A075B606 110 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Prop1P97458 223 aa11.94□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 P01837 106 aa11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm11733Q8BQP1 125 aa11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ighv1-19A0A0A6YWX0 117 aa11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Spink8Q09TK9 105 aa11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ifitm1Q9D103 106 aa11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trav4n-4A0A075B615 110 aa11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Klk5Q9D140 293 aa11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm17577J3QNF7 156 aa11.92□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Znrf2Q71FD5 238 aa11.92□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Igkv2-109A0A075B5K6 120 aa11.92□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trav13n-2A0A0G2JF93 110 aa11.92□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PtprfA2A8L5 1898 aa11.92□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Lst1O08843 95 aa11.92□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa11.91□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Plxnb1Q8CJH3 2119 aa11.91□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa11.91□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cox17P56394 63 aa11.91□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ociad2Q9D8W7 154 aa11.91□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Clec4b2Q67DU8 208 aa11.91□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Esm1Q9QYY7 184 aa11.9□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa11.9□□□□□ -0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa11.9□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Heatr5aQ5PRF0 2038 aa11.9□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Iglv1A0A075B663 117 aa11.89□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Srsf2Q62093 221 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa11.89□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Egr2P08152 470 aa11.89□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rspo1Q9Z132 265 aa11.89□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Odf1Q61999 247 aa11.89□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Q8C708 225 aa11.89□□□□□ -0.51
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.9 ms