Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JGW8

Igkv12-89, Immunoglobulin kappa chain variable 12-89 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Igkv12-89A0A0G2JGW8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igkv12-89A0A0G2JGW8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Igkv12-89A0A0G2JGW8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igkv12-89A0A0G2JGW8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Igkv12-89A0A0G2JGW8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igkv12-89A0A0G2JGW8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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