Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JGW8

Igkv12-89, Immunoglobulin kappa chain variable 12-89 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Igkv12-89A0A0G2JGW8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Igkv12-89A0A0G2JGW8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Igkv12-89A0A0G2JGW8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Igkv12-89A0A0G2JGW8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Igkv12-89A0A0G2JGW8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,55■■□□□ 1,52
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Igkv12-89A0A0G2JGW8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,09■■□□□ 1,45
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
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