Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ighv1-19A0A0A6YWX0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ighv1-19A0A0A6YWX0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,5■■□□□ 1,51
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ighv1-19A0A0A6YWX0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ighv1-19A0A0A6YWX0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,78■■□□□ 1,24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ighv1-19A0A0A6YWX0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
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