Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Prop1P97458 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prop1P97458 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prop1P97458 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prop1P97458 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Prop1P97458 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Prop1P97458 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prop1P97458 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prop1P97458 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prop1P97458 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prop1P97458 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prop1P97458 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prop1P97458 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prop1P97458 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prop1P97458 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prop1P97458 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prop1P97458 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prop1P97458 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prop1P97458 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prop1P97458 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prop1P97458 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prop1P97458 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prop1P97458 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prop1P97458 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prop1P97458 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prop1P97458 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prop1P97458 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prop1P97458 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Prop1P97458 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prop1P97458 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prop1P97458 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prop1P97458 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prop1P97458 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prop1P97458 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prop1P97458 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prop1P97458 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prop1P97458 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prop1P97458 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prop1P97458 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prop1P97458 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prop1P97458 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prop1P97458 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prop1P97458 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prop1P97458 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prop1P97458 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prop1P97458 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prop1P97458 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prop1P97458 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prop1P97458 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prop1P97458 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prop1P97458 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prop1P97458 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prop1P97458 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prop1P97458 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prop1P97458 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prop1P97458 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prop1P97458 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prop1P97458 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prop1P97458 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prop1P97458 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prop1P97458 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prop1P97458 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prop1P97458 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prop1P97458 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prop1P97458 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prop1P97458 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prop1P97458 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prop1P97458 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prop1P97458 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prop1P97458 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prop1P97458 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prop1P97458 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prop1P97458 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prop1P97458 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prop1P97458 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prop1P97458 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prop1P97458 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prop1P97458 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prop1P97458 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prop1P97458 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prop1P97458 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prop1P97458 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prop1P97458 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prop1P97458 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prop1P97458 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prop1P97458 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prop1P97458 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prop1P97458 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prop1P97458 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prop1P97458 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prop1P97458 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prop1P97458 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prop1P97458 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prop1P97458 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prop1P97458 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prop1P97458 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prop1P97458 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prop1P97458 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prop1P97458 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prop1P97458 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms